六种龟的分子分类学研究

来源 :暨南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:BlueHeart1111
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目前,国内外已有很多学者用18S rRNA、28S rRNA、12S rRNA等来研究龟类的系统发育关系.但用Cytb基因来研究龟类系统发育的,尚未见报道。所以,本文用Cytb作为控制区,来研究六种龟的分子生物学分类,以求为其系统发育提供更多的可靠数据。本文从六种龟的肌肉中提取DNA后,进行PCR扩增,然后对测出的序列用基因分析软件MEGA4.0和Clustax 4.8进行分析,并构建系统发育树。结果如下:(1)六种龟的1249bp碱基对中,等同碱基对为813bp,其中TT 208bp,CC244bp,AA 251bp,GG110bp;转换碱基对为170bp,TC 101bp,AG 69bp;颠换碱基对为163bp,TA 42bp,CA 49bp,CG 38bp;转换与颠换比为1.0。(2)广东乌龟和乌龟的C为1142个,V为7个,与其它四种龟相比,二者的保守位点最多,说明二者亲缘关系最近;安南龟和黄喉拟水龟的C为1036个,V为106个,相比于其它四种龟,二者的保守位点最多,变异位点最少,说明二者的亲缘关系最近;巴西龟和缺颌花龟的C为1105,比其它四种龟的亲缘关系近。(3)从构建的系统发育树,可见:巴西龟位于树的最底部,与缺颌花龟的亲缘关系较近;广东乌龟和乌龟的亲缘关系较近,位于树的中央;黄喉拟水龟和安南龟位于树的最上部,亲缘关系较近。
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