目的:本研究旨在从肠道菌群结构的角度来探讨凝结芽孢杆菌对小鼠肠道菌群的影响及大肠杆菌攻毒后凝结芽孢杆菌对小鼠肠道菌群的保护作用。通过此研究为凝结芽孢杆菌通过调节肠道菌群进而提高机体抵御能力提供理论依据。方法:空白对照组（生理盐水100μL）、凝结芽孢杆菌低、中、高剂量组（浓度分别为10⁷CFU·mL-1、10⁸CFU·mL-1、10⁹CFU·mL-1,各100μL）,连续灌喂30天后,分别取小鼠盲肠内容物,利用高通量测序技术分析肠道菌群结构。大肠杆菌攻毒实验:饲喂小鼠生理盐水和三种浓度凝结芽孢杆菌30天后腹腔注射100μL大肠杆菌悬液（CE组、TEL组、TEM组、TEH组）,并设置饲喂30天生理盐水后腹腔注射100μL生理盐水的对照组（CG1组）,分析五组小鼠盲肠内容物的肠道菌群结构差异。结果:（1）高剂量的凝结芽孢杆菌可以提高肠道菌群的多样性及丰富度。（2）PCoA、PCA和NMDS等分析结果表明饲喂凝结芽孢杆菌对肠道菌群的结构造成差异较大而饲喂浓度对其影响较小。（3）三种剂量的凝结芽孢杆菌组变形菌门丰度均显著增加,其中主要是副球菌属丰度的增加;高剂量组中疣微菌科（p<0.01）、疣微菌科Ruminiclostridium₉属及中剂量组中拟杆菌纲、普雷沃氏菌科、放线菌科（p<0.05）丰度显著降低。（4）腹腔注射大肠杆菌造成CE组小鼠30%的死亡,而其余四组存活率均为100%。（5）大肠杆菌攻毒引起小鼠肠道菌群丰富度的显著降低,其中δ-变形菌纲极（P<0.01）和红螺菌科（P<0.05）均显著降低;而对感染前小鼠饲喂凝结芽孢杆菌可显著提高小鼠肠道中厚壁菌门的丰度并降低变形菌门的丰度。（6）攻毒前饲喂凝结芽孢杆菌实验组相比未攻毒对照组可显著提高高产碱菌科、理研菌属-RC9相对含量（P<0.05）;可显著降低拟杆菌门、纲、目、科水平及紫单孢菌科、理研菌属相对含量（P<0.05）。（7）攻毒前饲喂凝结芽孢杆菌组相比饲喂生理盐水的攻毒组可显著升高厚壁菌门、梭菌纲、梭菌目、毛螺菌科、δ-变形菌纲、产碱菌科的相对含量（P<0.05）;可显著降低变形菌门、γ-变形菌纲、拟杆菌属、副杆状菌属相对含量（P<0.05）。结论:采用高通量测序技术分析小鼠肠道菌群结构,对比得出饲喂凝结芽孢杆菌可以在不改变优势菌群的前提下调节小鼠肠道菌群结构。大肠杆菌感染小鼠后通过高通量测序检测得出,饲喂凝结芽孢杆菌实验组在大肠杆菌感染下仍能显著增加厚壁菌门的丰度,增加肠道菌群多样性,维持健康的肠道环境,即凝结芽孢杆菌在肠杆菌科-埃希氏菌属攻毒下对机体具有保护效应。