自由贸易区合作是当今国际区域经济合作主要方式之一。但是,世界上现有的400多个自由贸易区中真正在区域经济发展中发挥作用的组织为数不多。那么从理论上分析,自由贸易区的经济效应,即贸易效应、投资效应及福利效应的形成与大小到底受哪些因素影响?现有自由贸易区的实践经验又给我们什么启示?正式基于这些疑问,笔者对自由贸易区的贸易效应、投资效应、福利效应及其影响因素进行了系统的学习研究。本文采用局部均衡模型和资本流动等模型,首先从理论上分析三大效应的形成及大小,并在此基础上研究影响性因素。接着,文章选取具有代表性的三个自由贸易区作为样本,比较他们不同的贸易效应和投资效应,并分析不同效应的影响因素。理论和验证结果同时显示:自由贸易区的贸易效应与成员国经济规模及区域市场扩展空间成正比,与成员国产业结构完整度和产业关联度成正比,与成立前成员国关税水平成正比;自由贸易区的投资效应与区域市场规模的大小成正比,与成员国资金充裕度成正比,与成员国自身要素禀赋的比较优势及投资环境的良好健康程度成正比;同时,自由贸易区依靠区内共同制度的权威性与有效性为贸易效应、投资效应与福利效应的形成与发展提供保证。在此分析基础上,文章就中国参与自由贸易区合作,在合作伙伴的选择以及区域共同制度建设等方面给出了相关的建议。