长期以来,我国高校是政府行政权力的附属物,政府对高校事务干涉过多、包办过多,致使高校深深陷入“行政化”的泥潭不能自拔。这种普遍存在的“行政化”现象根源于扭曲错位的政府-高校关系,从根本上来说,高校“行政化”是官僚科层制管理在高校管理中被滥用,如果无法重构政府-高校关系,高校“去行政化”问题就无从谈起,重构政府-高校关系已经成为“去行政化”无法回避的核心问题。通过梳理我国政府-高校关系的演变历程,对各个时期政府-高校关系特征、历史背景和深层次原因进行历史分析,指出当前政府-高校关系面临的困局。在此基础上,总结历次高等教育管理体制改革在政府-高校关系方面的实践探索,通过对南方科技大学的个案剖析,并借鉴民国时期(1912年-1949年)和美、英、日等国高等教育管理体制改革经验,并结合我国特殊国情和我国高等教育改革与发展的实际,指出重构政府-高校关系是我国深化高等教育管理体制改革的当务之急和现实课题。重点研究面对当前“去行政化”进程中政府-高校关系的基本矛盾困局,重构政府-高校关系应当从政治层面、政府层面、高校层面、社会层面四个方面同时努力,多管齐下:政治层面,应顶层设计先行、党政权力分离;政府层面,应厘清政府职责、简政放权、政校协同共治;高校层面,应打破内部管理官僚制、推进管理民主化;社会层面,推动社会广泛参与,创新高等教育治理机制。研究如何让政府、高校、社会协同共治,通过管理理念更新和制度创新推进高校“去行政化”改革。