基于单细胞转录组构建结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞图谱

来源 :哈尔滨工业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:whitewolf1573
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肿瘤相关巨噬细胞是浸润于肿瘤组织中的一类巨噬细胞,也是肿瘤微环境中最多的免疫细胞。在结直肠癌的环境中,巨噬细胞不仅浸润于肿瘤微环境中,也暴露于肠道的复杂环境中,表现出极大的异质性。我们通过单细胞转录组测序技术,解析结直肠癌微环境中肿瘤相关巨噬细胞的图谱,以研究巨噬细胞的异质性。我们通过AOM/DSS诱导ApcMin杂合子小鼠,成功构建了小鼠炎症相关的结直肠癌肿瘤模型。我们通过酶消化法,制备不同组织的单细胞悬液。我们首先对小鼠肿瘤和癌旁组织进行单细胞测序,后利用流式细胞术分选出肿瘤中CD11b+髓系细胞,再进行单细胞转录组测序,共得到六组数据。通过对六组数据的分别分析以及合并分析,研究其基因表达特征,通过可视化方法分析,展示了细胞簇之间的异质性,并发现巨噬细胞簇主要来源于单核细胞。我们还表征了两个CX3CR1+的巨噬细胞细胞亚群,其表达特征与单核细胞来源的结肠巨噬细胞的极化特征相似。分析表明许多巨噬细胞簇同时表达M1型和M2型巨噬细胞的基因标记,处于M1/M2细胞型的中间状态。按照Vegfa的表达水平可以将巨噬细胞簇为高、中、低三类。Vegfa表达高的细胞簇除了表达巨噬细胞簇的特征分子也表达TLRs、NLRs等炎症相关模式识别受体和NF-κB信号通路相关基因。一些细胞簇同时表达炎症小体和NF-κB负调节基因,共表达T细胞共刺激因子和T细胞免疫抑制因子。综上,通过单细胞转录组测序技术,我们构建了结直肠癌的肿瘤相关巨噬细胞图谱,为理解巨噬细胞在肿瘤微环境中的分布以及创建相关免疫疗法提供了参考。
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