隆额网翅蝗线粒体基因组全序列的测定与分析

来源 :陕西师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:drrrrr123
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
昆虫线粒体DNA是共价闭合的环状双链DNA分子,大小一般为15.4~16.3kb,以高拷贝数目存在于线粒体内。线粒体DNA的分子质量小,核酸序列和组成比较保守,基因组中不含间隔区和内含子,无重复序列和不等交换,拷贝数多,易于提取、扩增和分析:在遗传过程中不发生基因重组、倒位、易位等突变,严格遵守母系遗传方式,只需少量个体材料就能反映群体的遗传结构;基因组的替换率比核DNA高5-10倍,适合做进化生物学研究。 本文测定和分析了隆额网翅蝗线粒体全序列,并且将其于已经测出全基因组的2种其他直翅目昆虫的mtDNA进行了比较,并联合其他直翅类昆虫的mtDNA进行了线粒体全基因组水平的系统发育分析。获得的主要结果如下: 1.隆额网翅蝗线粒体基因组基因组成与基因排列 隆额网翅蝗线粒体DNA序列全长15783bp,包括13个蛋白质编码基因,2个核糖体基因,22个转运RNA基因,及1个长894个碱基的A+T丰富区,全线粒体基因组的A+T含量为76.4%。其基因排列顺序与非洲飞蝗的一致。隆额网翅蝗线粒体基因组在8个基因之间共有36bp的重叠区域,重叠范围在1bp到8bp之间变化。有114bp的基因间隔区,它们分散在20个基因之间,最长的间隔区长21bo,短的只有2bp。A+T丰富区位于核糖体12S小亚基和tRNAIle基因之间,A+T含量为86.0%,包括894个碱基,比其他昆虫的短一些。 2.隆额网翅蝗线粒体基因组蛋白质编码基因 隆额网翅蝗的密码子总数为3718,与非洲飞蝗的密码子(3713)总数接近。隆额网翅蝗编码基因的A+T含量为75.8%,它比非洲飞蝗的编码基因A+T含量高约1.7%。除COⅠ基因外,隆额网翅蝗的蛋白质编码基因的起始密码子都是典型的ATN密码子。其中ND2、COⅡ、ATP6、COⅢ、ND4L、ND6、Cytb这7个基因使用ATG作为起始密码子,ATP8、ND3、ND5基因使用ATT,ND4和ND1基因分别使用ATC和ATA。除COⅡ、ND5、ND4和ND1外,其他基因都是以TAA为终止密码子。亮氨酸Leucine(13.88%)、异亮氨酸isoleucine(10.87%)、丝氨酸serine(9.71%)、苯丙氨酸phenylalanine(9.23%)是隆额网翅蝗线粒体蛋白质中使用频率最高的4种氨基酸,总计占43.69%。 3.隆额网翅蝗线粒体基因组tRNA基因及tRNA二级结构 隆额网翅蝗线粒体DNA编码的22个tRNA基因零散分布于整个基因组中。从预测的二级结构来看,除tRNASer(AGN)外,所有tRNA都具有典型的三叶草结构。tRNASet(AGN)中,双氢尿嘧啶(DHU)臂只是形成了一个简单的环。tRNA的
其他文献
实验以玉米芯作为吸附剂,吸附绿色染料孔雀石绿。研究了影响吸附的主要因素,并通过正交实验优化吸附的最佳条件。结果表明:玉米芯粒径80-100目,溶液pH值=5,吸附温度25℃,吸附
将消费者的止步行为引入到供应链契约中,进而研究了考虑消费者止步行为的供应链收益共享契约。在考虑零售商缺货损失以及消费者的止步行为给零售商带来损失的情况下,求出了不
期刊
随着时代的发展,人们对餐饮的形式有了更加多元化的追求,餐厅,外卖,食堂,小摊小贩等,这对餐饮业的管理也提出了更高的要求,本文就同质化严重,缺乏标准化,餐饮营养意识淡薄这
爱国主义教育是培养大学生树立正确国家观、民族观的最主要途径。在新时代,高校要将爱国主义教育作为永恒主题,贯穿于整个大学时段,提高大学生的爱国意识,使他们将内心深处的
文化遗产保护与文化遗产产业化开发并不存在不可调和的矛盾。两者关注的核心都是文化遗产的“文化性价值”。因此恰当处理文化遗产保护与文化遗产产业化开发关系,实现两者的互
随着经济全球化的发展,贸易与投资自由化已成为国际趋势。技术性贸易壁垒是当今国际贸易保护主义的新动向,是非关税壁垒的重要组成部分,它对国际贸易的发展有双重影响影响。
民生问题是涉及到广大人民群众的根本利益的问题,是人民群众最关心、最直接、最现实的利益问题,也是中国经济社会发展务必要解决的一个现实难题。"民惟邦本,本固邦宁。"民生
雪窦寺与雪窦重显李富华据明初宋濂《护法录》所载《觉原禅师遗衣塔铭序》及其他资料记载,自南宋始,雪窦寺就名在江南禅宗的“五山十刹”之列,这说明早在宋朝,雪窦寺就已是中国禅
随着常规能源的枯竭,页岩油因其巨大的资源量而得到越来越多的关注,开采技术得到迅猛发展。水基钻井液是实现页岩油经济高效开发的必然途径,当前我国页岩油大都采用油基钻井