PPP模式作为一种基础设施和公共服务的创新供给机制,近年来在我国新一轮推广基础设施和公共服务领域中迎来高速发展。这其中既与在新型城镇化建设的背景下该模式迎来了发展机遇有关,也与PPP模式对于促进经济结构转型升级、加快转变政府职能、提升国家治理能力现代化的重要作用密不可分。PPP模式通过市场化运作引入多元化、可持续的资金投入机制,激发民间投资活力进而做到盘活社会存量资本以及整合社会资源,在缓解政府短期投资压力的同时,还能以最低的成本为公众提供高质量的服务,发挥政府和社会资本各自的优势,形成互利合作关系。此外,推广PPP模式也有利于加快转变政府职能、提升国家治理能力现代化,规范的PPP模式能够将政府的公共服务职能与社会资本的管理效率、技术创新进行结合,减少政府对市场干预,有利于简政放权,更好实现政府职能转变。然而,在推动PPP模式发展的过程中,这一模式背后存在的相关税收问题不容忽视。我国目前并没有制定关于PPP的专属性税收优惠或政策指引,与PPP模式相配套的税收优惠政策也不尽合理。PPP模式中的税收问题对整个项目的现金流、运作方式、盈利程度乃至整个项目的投资回报率都有着较大的影响,其中增值税问题贯穿于PPP项目全生命周期,尤其是“营改增”以后,PPP项目中的增值税将会产生更大影响。因此,对我国PPP模式中特殊目的载体的增值税征收工作进行改进就显得极为迫切。本文采用案例分析的方式,通过具体案例并结合我国目前PPP模式的增值税处理现状,对特殊目的载体在项目不同阶段的增值税问题进行分析,发现在我国现行税收制度框架下,我国PPP模式中特殊目的载体在项目运行的不同阶段存在税收优惠政策的不合理性、特殊事项的税收政策缺乏确定性以及相关税收征管工作缺乏配套性等问题,具体表现就是:建设期增值税留抵税额过大、土地征迁费无法抵扣进项税额、政府付费收入征税不明确、移交阶段存在重复征税。基于上述问题的分析,本文认为应从提高期末留抵税额退税比例和扩大PPP项目增值税的优惠范围两个方向去完善增值税优惠政策,在优化特殊目的载体增值税税务处理上需要明确其运营收入的增值税适用政策、完善增值税差额征税政策、统一移交阶段的增值税政策。最后,加强PPP模式中特殊目的载体的征管工作也需要做好相关税种的配套工作以及建设税务专业人才队伍。