黄河三角洲柽柳群体遗传多样性的研究

来源 :南京林业大学 | 被引量 : 12次 | 上传用户:wuheman
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本文采用随机扩增多态DNA(RAPD)分子标记技术,研究了黄河三角洲主要优势树种之一柽柳(Tamarix chinensis)的遗传多样性,揭示其群体遗传结构,并在遗传多样性研究的基础上,探讨柽柳种质资源的保存方法。主要结果如下: 从700条RAPD引物中筛选出26条,对3个天然群体共150个体进行了扩增和分析,26个RAPD引物共扩增出262条重复性高、清晰的谱带,分子量从200bp到2200bp不等,其中105条为多态,得出物种水平的多态条带百分率(PPB)为39.31%,Nei的基因多样度(h)为0.4061,Shannon多样性指数(J)为0.5917。表明柽柳物种内存在较高的遗传多样性。柽柳适应性强,环境选择压力小,人类活动相对较少是柽柳保留丰富遗传多样性的主要原因。 POPGENE给出的基因分化系数(Gst)为0.0507,基因流的值为9.3564;分子方差分析(AMOVA)在总遗传变异中,群体世界传变异占7.17%,群体内占92.83%。表明群体的遗传变异主要存在于群体内,群体间基因交流频繁。连续分布、兼性异交、繁殖能力强以及频繁的基因交流等特点可能是导致柽柳群体间遗传分化小的原因。遗传距离与地理距离具有显著相关性。 从来源于多枝柽柳(T.ramosissima)的5030条EST序列中,检索出包含SSR的EST序列101条。其中含二核苷酸重复单元和三核苷酸重复单元的SSR-ESTs分别为38条(37.6%)和31条(29.7%)。选取10条设计引物用于中国柽柳的扩增,结果5对引物得到清晰的扩增条带,其中2对引物表现明显的多态性。说明用来源于同属植物多枝柽柳的EST-SSR标记来进行柽柳的遗传学研究是可行的。 检测了不同的采样方法对柽柳群体遗传学参数的影响,研究结果表明:群体遗传多样性的一些衡量参数:如A、h等受群体内样本大小的影响较小,当每个群体取30个个体时,能较好地代表群体的水平,而衡量群体遗传分化的参数Nm,Gst则受群体内样本大小的影响较大,当群体内取样数在45个以上群体间分化系数Gst和基因流Nm值变化才趋于稳定。对RAPD分子标记位点数与遗传差异信息可靠性间的关系进行分析发现:当位点数在20以下时,得到的遗传差异的信息极不可靠,而当位点数达到70时,就能获得比较稳定可靠的信息。
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