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微卫星是广泛存在于原核及真核细胞基因组中的简单串联重复DNA序列,并具有高度多态性,变异率极低,以孟德尔共显性方式遗传。人类许多肿瘤的发生、发展与基因组特定微卫星DNA遗传的不稳定性(Microsatelliteinstability,MSI)及相应等位基因的杂合性缺失(Lossofheterozygosity,LOH)有关,某些特异染色体微卫星的LOH多同时伴有该位点上的抑癌基因失活,并在肿瘤的发生发展过程中发挥重要作用。许多散发性肿瘤如白血病、膀胱癌、黑色素瘤、胶质瘤、脑膜瘤、神经母细胞瘤中均发现有广泛MSI现象。现已证实高等真核细胞中存在错配修复基因系统(Mismatchrepairgenesystem,MMR),参与复制后的修复,通过消除DNA合成的错误以保持DNA复制的稳定性和保真性;目前已知的MMR系统中土要包括6种基因,即hMLH1、hMSH2、hMSH3、hPMS1、hPMS2和hMSH6。当MMR.基因功能失活(如基因突变、启动子区甲基化),就不能修复DNA复制过程中的错误,易导致微卫星DNA重复序列的不稳定性,表现为MSI和LOH。因此,对胶质瘤中微卫星不稳定性研究有助于认识胶质瘤发生、发展机制,更好揭示胶质瘤发病分子基础。 实验材料和仪器 1.实验材料:星形细胞瘤标本来自浙二医院神经外科手术标本,同时取患者外 浙江人学硕t研究生学位论文周静脉血作为正常组织DNA对照。试剂:蛋白酶K、TaqDNA聚合酶等购自丹麦***O公司。氯仿、异戊醇、乙醇、醋酸钠等购自杭州长征化学试剂厂。2.实验仪器:恒温箱:宁波江南仪器厂。PCR电泳仪和超速离心机:北京六一仪器厂。紫外分光光度仪:上海分析仪器厂。 实验方法1.DNA的抽提 ①组织林本DNA的抽提:将组织碾碎后蛋白酶K消化,50oC孵育门~18小时。等体积酚/氯仿/异戊醇抽提 DNA,醋酸钠、乙醇沉淀,TE溶解,4 t保存。 ②血液标本DNA的抽提:蛋白酶K消化,50℃水浴中1小时。酚/氯仿/异戊醇抽提DNA,无水乙醇及醋酸钠沉淀,TE(3-羟甲基-氨基乙烷-乙二氨四乙酸)溶解,4℃保存。2.微卫星PCR扩增 选用Dgsl 71、DgS 65、D9554、APOCZ、D19SllZ、HRC等6个微卫星位点上仕1丁了不mll。u以卜日已n IVH勺l十U广卜yu人八LJCflOITICIna辽a0s e LflT[D://gQDWZ口口.Of ii2Q口/查获,引物山中科院上海细胞生物所合成。PCR反应体系为:50mmol/L KCL,10mmol/L Tris一CI,1.smol/L MgCI*,200 u rnol几 dNTPs,模板 DNA 200ng,上下游引物各 50pmol,TaqDNA聚合酶 IU加水至 50 u L。PCR反应参数为:94oC变性smin,然后进入循环(94℃50秒,55aC 60秒,72℃60秒,)共35个循环,最后72oC延伸10min,4C保存。3.变性聚丙烯酚胺凝胶电泳 制备8%变性聚丙烯酚胺凝胶,取KR扩增产物IOUI,与等体积的变性加样缓冲液混合后于 95 aC变性 10min,冰上骤冷,取 15ul逐一上样。400V恒压电泳,根据指示剂二甲苯青的位置判断产物泳动位置。 一3 一 浙江大学硕士研究生学位论文4.银染显色 将带胶的玻璃板分别用 10%乙醇和 1%硝酸处理 smin,蒸馏水漂洗,用 0.2%硝酸银溶液染色 10min,蒸馏水漂洗后用 1.5%NaOH、0.4%甲醛溶液显色至带型清晰,照相用于结果分析。5.结果判断 分析电泳图谱,MSI定为肿瘤组织相对于正常组织出现条带的数量及大小的 改变。*OH为肿瘤某一等位基因条带消失或相对密度减少50%以上。所有实验 数据利用 SPSS.0 FOR WINDOWS统计软件包进行处理。 结 果 本实验所采用6个微卫星位点的染色体位置及引物序列见表1。 46例星形细胞瘤的M剐分析表明:共有刀例存在Mm(47.8%);LOH共有14例(30.40),其中I~11级3例(6.5O),Ill-IV级11例(23.9o),具体位点参见表二,可见肿瘤的恶性程度高低与*OH的发生有显著差异(P<0刀5),且 19号染色体的*OH与肿瘤的恶性程度高低之间也存在显著差异(P<0刀5)。 表1 微卫星引物序列及染色体位置 引物名称 引物序列5’-丁 染色体位置 5’。AGCTAAGTGAACCTCATCTCTGTCT3’ DgS171 gpterp22 5’,ACCCTAGCACTGATGGTATAGTCT3’ 5’-GACTTTGGCTGCTAGATGTG-3’ Dgsl65 gpZ19qZI 5’-CAGAGGAGTTACAAATATGACAGG-3’ 5’-GAAAGTCCAGAACTAAGTAG-3 *9%习 印21 5’-TGTGGATAGGTAWGC-3’ 5’,CATAGCGAGACTCCATCTCC-3’ APOCZ 19ql3二 5’-GGGAGAGGGCAAAGATCGAT3 5’-