虚拟企业是一个开放性的复杂系统，虚拟企业的管理是一个复杂的系统过程，其实质就是伙伴之间关系的协调管理，其目的就是提高和维持虚拟企业系统的有序性，使其处于协同状态。因此，本文首次从研究虚拟企业的自组织形成机制入手，围绕“协同”研究虚拟企业的协调作用机理，以模块化思想指导解决虚拟企业的复杂性问题，对虚拟企业协调机制的形成机理、虚拟企业的组织协调机制、虚拟企业的生产计划与控制以及虚拟企业协调的保障机制等进行研究。以某制造企业的虚拟运作为例，证实相关理论研究的适应性。论文通过分析虚拟企业的复杂性、自组织性及模块化特性，指出模块化是协调虚拟企业复杂系统的有效方法；从系统科学角度分析虚拟企业协调的核心地位，通过虚拟企业协调与协调机制的概念界定，构建虚拟企业协调机制的结构模型：由决策层、运作层与信息层协调机制以及组织协调机制和协调保障机制构成。运用协同学理论，分析提出适应市场中反应能力与速度，对共同目标的认可、对合作伙伴知识与能力的需求和增多的学习机会是虚拟企业自组织形成的动力条件；提出合作伙伴在相互竞争和协同过程中，产生了适应环境的新结构和相应的运作准则——虚拟企业的序参量，支配着虚拟企业系统达到协同状态。构建以有价值差异、互动沟通以及联盟学习为内容的虚拟企业协调逻辑模型，提出伙伴企业的有价值差异是互动沟通与联盟学习的动力，互动沟通与联盟学习的过程就是达成协同的过程；初次提出虚拟企业的运作准则、协调决策模式及协调行为模型是虚拟企业协调机制形成的三大基石。提出虚拟企业是由核心企业、盟员企业和成员企业构成的组织体系；在分析虚拟企业模块化组织三要素：产品的模块化、价值链的模块化和企业的模块化基础上，构建基于联邦／星形的虚拟企业模块化组织结构模型，该组织体系与结构在实现虚拟企业灵活性的同时能有效减少管理与协调上的复杂性，较好的解决集中控制与分布自治的问题，为虚拟企业提供了一种较好的组织协调机制。探索将延迟策略和虚拟企业生产协调过程结合起来，以虚拟企业的模块化组织结构为基础，进行客户定单分离点的重新定位，实现生产计划与控制对象前移、控制延迟与交付延迟；在MRPⅡ和分层动态BOM的基础上，设计虚拟企业生产计划与控制的总体模型，该模型具有较好的敏捷性与柔性，可减少产品个性化的生产比例，降低虚拟企业PPC过程的复杂性与难度。在提出沟通与信任是虚拟企业协调机制建立和运行的支持与保障的基础上，构建虚拟企业沟通机制框架及运作模型，提出沟通理念、沟通政策、沟通内容、沟通渠道和沟通反馈构成虚拟企业沟通机制的要素，而虚拟企业沟通氛围的营造、沟通制度的制定、沟通策略与技能的应用及信息沟通平台的建设是虚拟企业沟通机制有效运作的保障。