黄河是全国流域治理的重点区域,其生态保护补偿类型复杂、涉及省内省际双重补偿、补偿需要随时空调整、补偿省份发展的不均衡等特征已成为流域生态保护补偿中亟须克服的深刻障碍。首先,通过对流域生态保护补偿概念的梳理,选择“法益调整补偿说”并确定生态补偿为单向补偿,仅包含正外部性补偿的受益者对生态环境的建设者和保护者进行的保护补偿。其次,通过对全国、地方和流域专项立法与政策演进的梳理,分析我国黄河流域生态保护补偿立法现状。全国层面,流域生态保护补偿制度将由过去的原则性规范逐步程序化,但距离体系化尚有差距;地方层面,流域生态保护补偿制度缺乏具体明确的实施方案、使用标准和上位法支撑;流域专项立法层面,《黄河保护法（草案）》中对流域生态保护补偿制度的体系定位不合理性并且其内涵与《环境保护法》第三章第三十一条中“生态保护补偿制度”设计初衷相悖。再次,对我国现行黄河流域生态保护补偿实践现状从本章从法律体系、从制度内容、管理机制、政府职能与市场机制四个方面点明流域生态保护补偿存在的问题。从制度法理看,流域生态保护补偿相关概念界定不清并且立法体系不健全;从制度内容看,流域生态保护补偿补偿方式单一,补偿标准不统一,缺乏长效性,监督系统不完善;从管理机制看,管理体制碎片化和商机制流于形式;从政府职能与市场机制看,横向生态保护补偿中政府主导的补偿比重过大和财政转移支付使用效率低。最后,通过完善黄河流域生态保护补偿法律体系、制度内容、管理机制、政府职能与市场机制健全该制度。明晰黄河流域生态保护补偿的范围和完善全国、地方、专项立法以健全黄河流域生态保护补偿法律体系;增加黄河流域生态保护补偿方式和合理分配黄河流域生态保护补偿资金以完善黄河流域生态保护补偿制度内容;建立协同治理模式、加强流域补偿协议谈判和建立相关监管机构以明晰黄河流域生态保护补偿管理机制;推动政府职能转型、探索市场化生态补偿模式、突出市场主导作用和建立公众监督体系来扩大黄河流域生态保护补偿市场配比。