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DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰，在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用，是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入，各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。毛细管电泳是近年来迅速发展起来的一种分离分析技术，并成功地用于基因分析。本研究通过甲基化敏感的单链构象分析法与毛细管电泳技术相结合建立一种高效、灵敏、自动化的DNA甲基化检测方法。本研究以三个纯种亲本大白猪、长白猪和梅山猪及其正反交大白猪×长白猪、长白猪×大白猪、大白猪×梅山猪和梅山猪×大白猪杂交猪为试验对象，应用单链构象多态性-毛细管电泳分析方法检测肌肉组织IGF2第二启动子甲基化状态，从不同杂交组合角度，比较了亲本与子代之间在启动子甲基化水平上的差异，并进一步结合生产性状资料进行了相关分析。获得的主要结果如下：1．建立了检测基因启动子甲基化状态的单链构象多态性-毛细管电泳分析方法。2．利用上述基于毛细管电泳的基因甲基化分析平台，测定了IGF2第二启动子与MYF5启动子的甲基化状态。3．肌肉组织中，IGF2基因第二启动子发生甲基化的比率表现为杂种猪均低于纯种猪。4．对不同品种间IGF2启动子甲基化水平的差异进行了比较，长白猪与其他六个猪种之间差异达到极显著水平(p＜0.01)。梅山猪与大梅猪之间差异达到显著水平(p＜0.05)。5．利用SAS统计学软件，对IGF2启动子甲基化水平与生产性状资料进行了关联分析：在65头大白、长白及其杂种猪中，IGF2启动子甲基化水平对一系列背膘厚性状、眼肌高、眼肌面积、肥肉率、瘦肉率相关性差异显著(p＜0.05)或极显著(p＜0.01)。对于肉质性状，IGF2启动子甲基化水平与性状的相关性不明显。6．在120头梅山及梅大、大梅杂种猪中，IGF2启动子甲基化水平与眼肌高、眼肌面积相关性差异显著(p＜0.05)或极显著(p＜0.01)。对于肉质性状，IGF2启动子甲基化水平与背最长肌含水量相关性差异显著(p＜0.05)，与背最长肌pH值，背最长肌失水率，背最长肌系水率，背最长肌肌肉色值相关性差异极显著(p＜0.01)。