水稻4号染色体BAC 1365序列测定分析以及水稻ALDH,RLK,PP2A-A基因结构和功能的研究

来源 :中国科学院研究生院(上海生命科学研究院) | 被引量 : 2次 | 上传用户:wp87825385
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
广陆矮4号水稻亚种的基因组BAC文库亚克隆BAC 1365位于水稻4号染色体长臂82.9cM处,由探针G282定位。我们对该BAC 克隆的127563bp的序列进行精确测定并综合利用各种软件分析这段序列中可能存在的蛋白编码基因,在这个BAC克隆中共发现了15个基因。多种软件预测及同源比较和结构分析表明BAC 1365上有一个编码乙醛脱氢酶的基因,并且数据库中也有EST数据证明该基因是表达的,我们对这个基因进行了深入研究:首先,利用RT-PCR及5’-RACE方法克隆了该基因的全长cDNA,命名为OsALDH1; Southern实验证明该基因以单拷贝形式存在于水稻基因组的7.9kb的HindIII酶切片端上;Northern实验证明OsALDH1基因在植物处于厌氧状态时其表达量明显增高,说明OsALDH1基因可能参与植物厌氧生长的调节;在E.coli中表达的OsALDH1蛋白,也具有明显的乙醛脱氢酶活性,在体外能催化乙醛氧化成乙酸;我们还通过根瘤农杆菌介导的植物转化系统,将OsALDH1基因的启动子区转入到水稻的愈伤组织中,深入研究了OsALDH1基因的启动子活性。此外,在对本实验室已测完的一段323kb的序列分析时,我们在其中发现了一个大的S位点相关的受体激酶簇,这个基因簇覆盖108kb的区域,由14个编码S位点相关的受体激酶的基因组成,我们将这个基因簇命名为OsRLK, 其上各个基因的命名是根据他们在基因簇中的位置从1-14命名;在OsRLK 2和OsRLK 3之间存在一个13kb的逆转座子,OsRLK 8被一个14.22kb的逆转座子打断;除了OsRLK 6之外,其他基因的转录方向一致。我们通过RT-PCR的方法研究了这个基因簇的各个基因的表达情况,证明了有9个基因是转录的,并且他们的转录模型是不同的:OsRLK 7,OsRLK 11主要在花,幼穗等生殖器官转录;而OsRLK 1,2,9,10,12,13,14则在根,幼芽,苗,花,幼穗等器官均有转录;我们还克隆了OsRLK 10,11,13,14四个基因的全长cDNA。另外,在早期的研究工作中我们还从水稻绿苗的cDNA 文库中筛选到了一个编码水稻磷酸酯酶2A 调节亚基A亚基的基因,命名为RPA1;RPA1基因在水稻基因组中是以单拷贝形式存在的,编码水稻PP2A 的A亚基,编码蛋白具有PP2A A亚基的保守杆状结构;将RPA1基因转入酵母tpd3突变系统中,酵母的表型恢复正常;<WP=5>以RPA1基因的cDNA序列为探针筛选BAC文库,共筛到了12个阳性BAC克隆,其中有7个克隆位于连续群354上,这7个BAC克隆都有一条16kb的BamHI酶切条带,该酶切条带完全包含RPA1基因;对这一16kb的条带测序并与RPA1基因的序列相比较发现RPA1基因共有12个外显子和11个内含子组成;由于连续群354是由探针RG409(X)定位于水稻的3或7号染色体上的,所以我们也认为RPA1基因是位于水稻的3或7号染色体上。
其他文献
泗棉3号是我国长江流域广泛种植的优良品种,是我国棉花常规育种法一项典型的成功范例,也是研究棉花高产性状的优良材料。研究该品种的产量及其构成因素的遗传规律,对我国棉花高
稻米垩白是一个重要的米质性状,它是指稻米胚乳中不透明的部分。具有垩白的稻米不仅外观品质差,而且在精碾时易碎,整精米率降低,蒸煮后使饭粒断裂或蓬松中空而影响食味。近年来,随
选用粳稻“浙粳27”和籼稻“浙农5号”为材料,测定不同碾磨程度的稻米直链淀粉含量,以明确不同稻米精白度对直链淀粉含量的影响。选用稻米品质差异较大的7个籼型不育系(A)及相应
最初看到Solidworks 2001给人的感觉是耳目一新.相对于以前的版本,Solidworks的用户界面有了很大程度的变化,最大的变化是最大限度地减少了对话框的使用,增加了绘图区域的可
东部草原露天矿区土地瘠薄、草场退化严重,生态修复成为必然。矿区草原表土缺乏,露天矿开采产生的生黏土资源化利用成为矿区生态修复的一种可行方法。磷是植物必需营养元素且在土壤中难移动,磷在不同黏土组成中的养分动力学特性对于合理利用黏土具有重要的现实意义。对黏土、表土、沙土、黏土沙土1∶1混合(NS1∶1)、黏土沙土1∶2混合(NS1∶2)、黏土沙土1∶3(NS1∶3)混合等6种土壤基质对磷的吸附解吸进行
植物来源的蛋白酶抑制剂种类众多,功能广泛。它可作为植物的储藏蛋白;也可与植物体内的蛋白质相互作用来调节蛋白质的代谢;更为重要的是,它可以作为植物抵抗昆虫和病原菌侵害的重
目的:建立测定人血浆可溶性血管内皮钙粘蛋白(sVE-cadherin)浓度的双抗体夹心酶联免疫吸附试验(ELISA)方法,并探讨其临床应用价值。方法:应用原核表达的人VE-cadherin重组蛋
双流县地处成都近郊,县域自东向西三面环绕成都主城区,面积1032平方米,辖21个镇、3个街道,人口92万余人。地理分布深丘、浅丘、平原各占1/3,受地域影响,24个镇、街道经济及基础差异