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广陆矮4号水稻亚种的基因组BAC文库亚克隆BAC 1365位于水稻4号染色体长臂82.9cM处,由探针G282定位。我们对该BAC 克隆的127563bp的序列进行精确测定并综合利用各种软件分析这段序列中可能存在的蛋白编码基因,在这个BAC克隆中共发现了15个基因。多种软件预测及同源比较和结构分析表明BAC 1365上有一个编码乙醛脱氢酶的基因,并且数据库中也有EST数据证明该基因是表达的,我们对这个基因进行了深入研究:首先,利用RT-PCR及5’-RACE方法克隆了该基因的全长cDNA,命名为OsALDH1; Southern实验证明该基因以单拷贝形式存在于水稻基因组的7.9kb的HindIII酶切片端上;Northern实验证明OsALDH1基因在植物处于厌氧状态时其表达量明显增高,说明OsALDH1基因可能参与植物厌氧生长的调节;在E.coli中表达的OsALDH1蛋白,也具有明显的乙醛脱氢酶活性,在体外能催化乙醛氧化成乙酸;我们还通过根瘤农杆菌介导的植物转化系统,将OsALDH1基因的启动子区转入到水稻的愈伤组织中,深入研究了OsALDH1基因的启动子活性。此外,在对本实验室已测完的一段323kb的序列分析时,我们在其中发现了一个大的S位点相关的受体激酶簇,这个基因簇覆盖108kb的区域,由14个编码S位点相关的受体激酶的基因组成,我们将这个基因簇命名为OsRLK, 其上各个基因的命名是根据他们在基因簇中的位置从1-14命名;在OsRLK 2和OsRLK 3之间存在一个13kb的逆转座子,OsRLK 8被一个14.22kb的逆转座子打断;除了OsRLK 6之外,其他基因的转录方向一致。我们通过RT-PCR的方法研究了这个基因簇的各个基因的表达情况,证明了有9个基因是转录的,并且他们的转录模型是不同的:OsRLK 7,OsRLK 11主要在花,幼穗等生殖器官转录;而OsRLK 1,2,9,10,12,13,14则在根,幼芽,苗,花,幼穗等器官均有转录;我们还克隆了OsRLK 10,11,13,14四个基因的全长cDNA。另外,在早期的研究工作中我们还从水稻绿苗的cDNA 文库中筛选到了一个编码水稻磷酸酯酶2A 调节亚基A亚基的基因,命名为RPA1;RPA1基因在水稻基因组中是以单拷贝形式存在的,编码水稻PP2A 的A亚基,编码蛋白具有PP2A A亚基的保守杆状结构;将RPA1基因转入酵母tpd3突变系统中,酵母的表型恢复正常;<WP=5>以RPA1基因的cDNA序列为探针筛选BAC文库,共筛到了12个阳性BAC克隆,其中有7个克隆位于连续群354上,这7个BAC克隆都有一条16kb的BamHI酶切条带,该酶切条带完全包含RPA1基因;对这一16kb的条带测序并与RPA1基因的序列相比较发现RPA1基因共有12个外显子和11个内含子组成;由于连续群354是由探针RG409(X)定位于水稻的3或7号染色体上的,所以我们也认为RPA1基因是位于水稻的3或7号染色体上。