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本文采用PCR-RFLP及PCR-SSCP分析方法，对我国地方猪种淮猪(黄淮海黑猪)、姜曲海猪、二花脸猪(江海型猪)和藏猪(高原型猪)的5个功能基因：生长激素(porcine growth hormone，pGH)基因、兰尼定受体(Ryandine receptor gene，RYR1)基因、Leptin(Obese)、激素敏感脂酶(hormone-sensitive lipase，HSL)、垂体特异性转录因子(Pituitary transcription factor，PIT-1)基因进行了多态性研究。实验结果表明，五个基因中，淮猪、姜曲海猪、二花脸猪和藏猪的五个功能基因中存在着广泛的基因多态。GH的HhaⅠ多态在四个猪种中都有分布，不同HhaⅠ基因型与产仔数无显著性差异；在四个地方猪种中RYR1的基因HhaⅠ酶切结果没有发现多态，其结果全部为NN型，不存在RYR1隐性基因n，SSCP分析二花脸和藏猪同一片断发现了一个突变位点的存在，试验未对其测序分析，在二花脸中RYR1基因不同的基因型之间的产仔性能存在显著的差异(P＜0.05)，而其他基因之间则没有显著差异(P＞0.05)，因此似可把RYR1作为影响母猪产仔数的候选基因进行研究；在淮猪中Leptin基因HinfI呈单态分布，在其他三个猪种中呈多态分布；对淮猪和姜曲海的PIT-1基因进行了MspⅠ酶切，发现了与国外猪种不同的酶切图谱。计算四个猪种之间的Nei’s遗传距离，运用UPMGA和NJ法聚类分析，UPMGA法发现淮猪和姜曲海间的遗传距离较近，先聚为一类，再和二花脸聚为一类，NJ法则淮猪与二花脸先聚为一类，再和姜曲海聚为一类，两种聚类方法都表明这三个品种与藏猪的距离最远，这种遗传距离的差异和他们原产地的地理距离相一致，地理分布上，由南到北分别是淮猪、姜曲海猪、二花脸猪，而藏猪基本上处于与外界隔离的西藏深山河谷中，属于封闭的群体。文中还对地方猪种的种质特性、猪种之间遗传距离的聚类、以及分子育种和畜禽种质资源的保护进行了探讨。