随着流域各地区经济的迅猛发展,水资源耗竭和水质污染日益严重,研究流域生态补偿势在必行。本文以福建-广东省境内的韩江流域为研究对象,基于水足迹和人类发展指数(HDI)基础理论,建立水福利绩效评价指标体系,应用数据包络分析法(DEA)综合评价流域水资源绩效,进而根据水资源供需分析,建立韩江流域生态补偿模型并进行核算,提出实施方案。结果表明：首先,2007-2013年间韩江流域水足迹总增长率达32.6%。其中农业生产虚拟水占流域水足迹总量54%；其次为污染与工业用水足迹,分别占27%与10%；流域水资源平均自给率达98.95%,人均水足迹1508.18 m3,接近世界平均水平(1564m3)；水资源压力指数约70%,处于水生态盈余状态。其次,2007-2013年韩江流域HDI总增长率为50.68%,其中,教育综合指数的贡献最大。水资源消耗量逐年增加,水福利绩效却严重滞后,表明韩江流域经济发展本质上属于要素驱动型的粗放发展；数据包络分析(DEA)结果显示,韩江流域整体发展处于规模递减阶段。最后,基于前述研究结果,根据水资源供需分析,韩江流域属于上下游都为水生态盈余的情形,根据构建相应生态补偿模型的核算结果,福建省对于流域综合治理需承担46%的治理费用,广东省承担54%的治理费用。