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目的：研究ApoE基因多态性与冠心病的发病关系，以及观察ApoE基因多态性对阿托伐他汀调脂疗效的影响。方法：选择2012年9月-2013年1月苏州大学附属第一人民医院心内科收治冠心病38例，同期入院的非冠心病人群30例作为对照组，采用全序列基因测序方法检测68位研究对象，同时冠心病组服药前、和服药12周后，分别空腹12小时采取肘静脉血，测定血脂水平。观察两组间基因多态性的分布有无差异，并观察冠心病组不同基因型服用同等剂量阿托伐他汀后疗效的差异。结果：1.冠心病组与对照组相比，两组间平均年龄、男女比例、总胆固醇、低密度脂蛋白、高密度脂蛋白等指标稍有差异，但无统计学意义；2.冠心病组共38例，其中以E3/3基因型26例(68.4%)，E4/4型1例(2.6%)，E3/4型8例(21.1%)，E2/3型3例(7.9%)，未检测到E2/2、E2/4等型；对照组共30例，E3/3基因型25例(83.3%)，E2/3型2例(6.7%)，E3/4型3例(10%)，未能检测到E2/2、E4/4、E2/4等表型。两组间的ApoE基因多态性分布无统计学意义；3.冠心病组中ε2、ε3、ε4等位基因发生频率分别为3.9%、82.8%、13.1%，对照组中ε2、ε3、ε4等位基因分别为3.3%、91.7%、5%，与对照组相比，冠心病组中ε4的发生频率明显升高，具有统计学意义(P<0.05)；4. E2/3组应用阿托伐他汀12周后，TG的下降和HDL的升高程度均低于E3/3组，但无统计学意义，TC、LDL-C的下降程度明显大于E3/3组，具有统计学意义(P<0.05)；5. E3/4+E4/4组TC和LDL-C下降程度大于E3/3组，但无统计学意义；TG和HDL-C的变化程度与E3/3组无明显差别。结论：（1）冠心病组与对照组中的ApoE多态性分布无明显差异。（2）ε4等位基因可能参与了冠心病的发生、发展，但是确切机制需要进一步的研究证实。(3)冠心病组不同基因型患者服用阿托伐他汀12周后的调脂疗效存在个体差异，ε2等位基因可能增加阿托伐他汀药物的疗效。(4)临床上检测ApoE基因型可以指导临床治疗，为个体化治疗提供依据。