药品专利反向支付协议是在医药领域出现的一种可能导致限制竞争效果的和解协议。本文从药品专利反向支付协议的界定出发,阐述了其法律性质和产生背景,分析了反向支付协议将会在我国大量产生的制度和产业基础,介绍了我国司法实践中已出现的相关案例。因药品专利反向支付协议中专利权的滥用会引发严重的限制竞争问题,故有必要对其进行反垄断法规制。但就我国现阶段立法情况来看,对反向支付协议的法律规制还存在诸多的局限性。结合域外已有的执法、司法实践,可总结出我国规制该问题的经验。我国应从激励创新、促进公平竞争以及提高药品可及性的价值目标出发,结合反垄断法制度体系、实施体制,以我国反垄断法对横向垄断协议“禁止+豁免”的基本框架为蓝本,构建具体的规制路径。在禁止层面,基于药品专利依强度可分为基础专利和次级专利的特点,分别适用美国合理原则和可抗辩的推定违法原则进行反垄断审查,以实现竞争利益的内部平衡;在豁免层面,缔约各方可适用比例原则限制下的公共政策抗辩进行个案豁免。同时,可从建立药品专利反向支付协议反垄断行政执法与专利诉讼的沟通机制、完善反垄断审查的豁免条款以及反垄断法私人执行制度三个方面对其反垄断规制进行完善,以期能全面、有效地应对药品专利反向支付协议问题。