随着我国经济高速发展,政府投资项目规模越来越大,如何有效利用项目资金,使项目能以最优的投资规模获得最大的社会效益和经济效益,并且使政府建设资金使用的社会满意度提高,已经成为理论界和政府管理部门共同关注和研究的核心问题。政府投资项目审计作为政府建设资金使用的有效监督手段,发挥着其不可忽视的作用,尤其是最近几年国家大力倡导的全过程跟踪审计,其监督政府资金正确合理利用的作用更加全面。但目前,我国工程建设项目审计还处在发展中阶段,特别是全过程跟踪审计还未完全得到全社会的认可,无论从理论上还是实际操作中都存在着诸多的问题。本文从政府投资项目全过程跟踪审计的概念入手,分析其必要性及优势,同时在梳理其每个阶段的具体内容中,找出现阶段存在的问题在于没有完整的全过程跟踪审计评价指标体系。基于构建体系的目的,利用系统论思想,以政府投资项目的一般规律为依据,从时间上基于工程建设项目的全过程,从空间上基于项目建设过程中涉及的管理、经济、技术三方面构建了政府投资项目审计体系的框架,理清了工程建设项目全过程的审计思路。并基于参与项目的各方,从管理、经济、技术三方面给出全过程各阶段的审计重点。此外,论文提出了政府投资项目全过程跟踪审计评价指标体系,运用层次分析法和模糊综合评价原理构建了政府投资项目全过程跟踪审计评价模型。论文还从侧面提出了完善我国政府投资项目全过程跟踪审计实施制度的若干政策建议,即建立健全政府投资项目全过程跟踪审计法律法规体系。