肺腺癌癌旁基因组异常情况分析及初步功能研究

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肺癌作为全世界发病率最高和致死人数最多的癌症,发病原因包括吸烟、职业暴露、空气污染和基因突变等,2015年中国肿瘤登记年报显示,肺癌仍居中国发病率的首位。半个多世纪以来全世界在肺癌的手术、放疗、化疗及靶向治疗方面取得了巨大的进展和成绩,但由于缺乏有效的早期诊断方法且肺癌患者出现症状时多为晚期,因而总的5年存活率不到15%。基因突变作为肺癌发生的诱因之一,突变率随着环境污染的加剧而不断提高,细胞癌变的概率也随之增加。肺癌的特点之一是具有异质性,对基因突变的分析对于揭示肺癌发生发展有重要作用,随着肺癌测序技术的快速发展,越来越多的突变基因被发现,其中包括EGFR、KRAS等一些肺癌发生中重要的驱动突变,为肺癌的早期诊断和靶向治疗提供了新的方向。与肿瘤组织一样,肿瘤的正常对照组织也同样暴露在烟草等环境致癌物中,为了研究这些组织基因组在环境致癌物中发生的变化,我们从TCGA数据库下载了513例肺腺癌病人的全外显子数据,筛选出癌旁特有的基因组异常点并过滤掉体细胞突变,统计突变特征并对病人进行生存分析后绘制病人生存曲线,然后选取癌旁组织突变与病人预后相关的基因进行初步的功能研究。在癌旁组织突变基因中,外显子突变频率为0.93/Mb,碱基突变以C:G>T:A的置换为主,有29个基因突变率大于3%,其中ZNF511和TMEM184A与预后成正相关,其中ZNF511在513例病人中有16例癌旁发生突变且该基因存在三种突变情况,突变的结果是蛋白质产物的缩短或延长,癌旁中ZNF511发生突变与病人的预后是成正相关的。然而目前对于ZNF511基因功能还尚未有研究,因此我们想通过基因的过表达和干扰对ZNF511进行初步的功能研究。因此我们对ZNF511瞬时转染同时构建慢病毒稳转株,设计并合成了小RNA干扰序列在肺腺癌细胞系A549细胞中进行干扰,初步显示敲低ZNF511后对细胞增殖能力有一定抑制作用,且可以引起pAKT的下调。总之,本文对肺腺癌中正常的对照组织基因组变异情况进行了系统的分析并对ZNF511基因功能做了初步研究,为肺癌发生发展的机理提供了全新的思路。
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