【摘 要】
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本研究通过对山羊子宫内膜样品进行全基因组亚硫酸氢盐测序(WGBS)和生物信息学分析,研究了山羊子宫内膜容受期的全基因组DNA甲基化图谱。获得163.06 Gb的测序数据,平均每个样品81.53 Gb。分析发现在子宫内膜容受前期(PE:妊娠第5天)和容受期(RE:妊娠第15天)中全基因组DNA甲基化存在显著差异。主要研究结果如下:1.与PE组相比,在RE组中有高达16467个差异甲基化区域(DMRs
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本研究通过对山羊子宫内膜样品进行全基因组亚硫酸氢盐测序(WGBS)和生物信息学分析,研究了山羊子宫内膜容受期的全基因组DNA甲基化图谱。获得163.06 Gb的测序数据,平均每个样品81.53 Gb。分析发现在子宫内膜容受前期(PE:妊娠第5天)和容受期(RE:妊娠第15天)中全基因组DNA甲基化存在显著差异。主要研究结果如下:1.与PE组相比,在RE组中有高达16467个差异甲基化区域(DMRs)的甲基化程度较高;21391个DMRs的甲基化程度较低(p≤0.05和log2(倍数变化)≥2)。2.与PE组相比,RE组IGF2BP2,ACOX2,PTGDS,VEGFB和PTGDR2基因的甲基化率显著降低(p≤0.05和log2(倍数变化)≥2),IGFBP3和IGF1R基因的甲基化率显著增加(p≤0.05和log2(倍数变化)≥2)。3.KEGG分析结果表明,这些基因参与了胰岛素、丝裂原活化蛋白激酶、促性腺激素释放激素、血管内皮生长因子和孕酮介导的卵母细胞成熟的信号传导途径,而这些信号转导通路参与调节山羊子宫内膜的容受性。综上所述,本研究分析了奶山羊妊娠期第5天和15天子宫内膜全基因组DNA甲基化模式,结果表明:IGF2BP2,PTGDS,VEGFB,PGR,IGFBP3和IGF1R基因可能在调节子宫内膜容受性方面具有潜在的应用价值。
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