本研究是以甜瓜(Cucumis melo L.)雌雄异花同株(单性花)的基因型材料Fi-155(P1)、S160-1(P2)为母本和雄花、两性花同株(两性花)的基因型材料Fi-1(P3),Fi-2(P4)、Fi-3(P5)、Fh-232-3(P6)为父本,通过杂交、自交和回交等方法,分别获得F1、F2、BC1、BC4S6等不同世代的试验材料,这些材料用于甜瓜花性型分离规律的研究以及与单性花基因连锁的RAPD分子标记筛选的研究。通过对其不同世代花性型的遗传分析,结果表明:通过单性花和两性花的基因型材料杂交获得F1代全部为单性花株,这表明供体材料P1、P2单性花性状由显性基因控制且单性花性状遗传相当稳定。通过对F2、BC1、BC4S6等不同世代的花性型分离情况进行调查,经卡方检测,均符合由单显基因控制的分离比例,由此表明供体材料的单性花性状受单显性基因控制的质量性状。对P2和P6杂交后自交获得的F2代群体采用随机扩增多态性DNA分子标记进行分析。甜瓜基因组DNA采用改良的CTAB法提取,反应体系的优化采用的是单因素递进筛选法,对上一轮筛选出的某个因素的最佳值作为固定值使用到下一轮的因素筛选中,由一个因素的最佳值筛选到另一个因素的最佳值,这样层层递进能得到随单因素浓度变化而变化的连续扩增式样,从而能建立稳定的RAPD-PCR反应体系。结果表明:在20μL反应体积中,RAPD优化的反应体系为模板DNA浓度为3.75ng/μL、dNTP浓度为0.25mmol/L、随机引物为0.50μmol/L、Taq DNA聚合酶为1U/rec。此反应体系的建立为RAPD分析在甜瓜分子标记辅助育种打下了良好的基础。利用200条10个核苷酸的随机引物采用分群法(Bulked segregant analysis strategy,BSA法)对F2群体进行筛选,筛选出5条在两池间具有多态性的标记,经单株检测表明只有引物T16571550具有特异性,在大多数单性花单株中均可扩增出一条约550bp左右的特征带,而在两性花单株中则未见。因此将此与甜瓜单性花基因连锁的分子标记特异性片断命名为T16571550 ,该标记可用于辅助甜瓜单性花的选育。