前口虫属纤毛虫原生动物的系统分类学研究

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前口虫属(Frontonia Ehrenberg,1838)作为寡膜纲咽膜亚纲中最大的一个属,其成员分布于淡水、土壤和海水等多种生境中。该属总体上呈现出相似的形态,并形成了一个较好识别的分类类群。作为研究最多的属之一,该属内仍存在部分物种基本形态描述定义不清、内部系统关系解释不明、DNA条形码数据不足等问题。本研究利用多基因(SSU r DNA、ITS1-5.8S-ITS2、LSU r DNA、Cox I)测序、系统学分析和多种形态观察技术,以7种前口虫(F.paramagna,F.fusca,F.leucas,F.atra,F.apoacuminata,F.depressa和F.sp.)为材料,探究了该属的若干系统分类学问题。主要研究结果如下。1.对先前定义不清的2物种给予了补足性描述。首次明确了F.depressa口区小膜3的基体列数,并补足了伸缩泡的大小、收缩时间等特征,给予了该物种新定义;发现F.paramagna种群内部伸缩泡数量的高度变化,更新了该物种定义中的伸缩泡特征。2.首次增加了F.depressa的多基因数据,并基于此发现了居于所有Frontonia基部位置的新分支(分支IV),显示了该属内部关系的复杂性被低估。F.paramagna和属的模式种F.leucas所在的分支II为核心分支,包括两个小的分支,在任何系统发育树中均处于稳定地位,是所谓的“真正的”Frontonia;F.fusca所在的分支I除了在Cox I系统树中与分支II聚到一起之外,其余情况下仍与草履虫科Parameciidae聚到一起,拓扑结构测试(AU test)显示该分支的系统发育位置处于不确定的状态;F.atra和F.apoacuminata所在的分支III与其他Frontonia分支的姐妹关系除在Cox I中不被拒绝之外,所有其他标记基因都显示出拒绝,因此分支III的地位是相对确定并总是与春锥虫科Stokesiidae聚到一起。3.揭示了3个系统分支代表阶元的咽微纤丝形态,并发现分子系统发育树中不同分支物种的咽微纤丝形态不同,显示咽微纤丝或许能够成为解释本属系统内部遗传分支现状的一个新的形态学角度。利用Flutax直接荧光标记法和透射切片观察等方法对F.paramagna,F.leucas,F.atra,F.apoacuminata,F.dep ressa咽微纤丝进行了初步探究。发现处于核心分支II的F.paramagna和F.leuc as咽微纤丝主要分布在口区右侧围口动基列处(N-vk1-3)、口区左侧包括口区小膜3处(N-p3)和口后动基列处(N-pk)以及口后缝合线延伸至体末端处;口区左右两侧呈明显连接的“包裹”状态。处于分支III的F.atra和F.apoacum inata的咽微纤丝口区左右两侧的分布与上述核心分支相同,但并未明显连接呈“包裹”状态且口后缝合线处几乎无延伸。最外围的分支IV中的F.depressa的N-vk仅包含两列,左右两侧的咽微纤丝未直接连接而是通过深部纤维网连接,口后缝合线处也几乎无任何延伸。4.利用DNA条形码揭示了2个形态种(F.fusca和F.depressa)中或存在隐藏种分化。对多种基因的遗传距离进行比较发现所有的遗传距离远远大于前口虫种内遗传距离的标准。F.fusca宁波春晓湖种群与NCBI所提供的广州种群的遗传差异远远小于东沙滩种群与广州种群的遗传差异,特别是在ITS(0.5%vs7.1~8.9%)和Cox I(2.5%vs 28.2~28.9%)中;F.depressa两种群之间的差异体现在所有涉及到的条形码中,即ITS1(23%)、ITS2(19.4%)、LSU-D2(10.4%)和Cox I(16.1%~17.2%)。本研究完善了2个物种分类学定义,增加了81条系统发育和DNA条形码标记基因,并且首次结合系统发育关系比较分析了咽微纤丝的系统学意义。为纤毛虫的α-分类学、DNA条形码数据库积累提供了新资料,为复杂系统关系的解析提供了新的形态学视角。
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