东秦岭熊耳山南麓木头沟钼矿位于华北板块与扬子板块接壤的华北板块南缘的熊耳弧后裂陷盆地内，即现今秦岭造山带后陆冲断褶带华北板块南缘熊耳山地块的东部，南与旧县嵩县盆地相毗邻。研究区钼矿体主要赋存于角砾岩筒中，矿体主要受角砾岩筒控制，钼矿体与角砾岩体成大致对应关系，通过对木头沟钼矿区岩石化学、氢氧同位素、硫同位素、铅同位素、稀土元素和流体包裹体的分析与研究，结合前人的研究成果，对矿区的成矿物质来源、矿床机理及成矿构造动力进行探讨。本矿成矿时期跨越了印支-华力西运动晚期和燕山运动的早、中期，并以燕山运动早期的晚三叠世为主。通过成矿时限说明，东秦岭木头沟钼矿成矿物质并非来源于与其相邻的花山岩体与五丈山岩体。本区的矿化特征符合一般热液型矿床的特征：矿化温度属中高温范围；钼矿体主要赋存于角砾岩筒中，矿体主要受角砾岩筒控制。对矿床的成矿时限、稀土元素、铅同位素、氢氧同位、硫同位素及流体包裹体分析可以得出，本矿床的成矿物质来源于深部，属于幔壳混合型，在成矿地球动力学背景下，对东秦岭钼矿床成矿机理进行探讨，得出矿质通过切穿地幔的秦岭褶皱带北缘逆冲断层向上运移，最终受到马超营断裂的控制。成矿构造动力主要来自于因碰撞造山与岩石圈加厚形成山根，造成新的物质与热结构状态，从而导致产生壳、幔物质重力与密度差，以及热状态的变化，引起地壳和上地幔内物质状态与各圈层关系的剧烈变动调整。