20世纪90年代以来，信息技术迅猛发展，随着互联网技术地普及和应用，电子政务成为当代信息化最重要的领域之一，受到各级政府的重视。作为电子政务的重要组成部分和电子政务发展程度的主要标志的政府门户网站，是提供电子政务公共服务的重要窗口，是各级政府履行职能的重要渠道，是深化行政管理体制改革的重要平台。对政府门户网站管理部门进行绩效评估有助于了解政府门户网站建设的现状，进而对其进行规范和引导。本文以平衡计分卡、关键绩效指标、新公共管理理论、新公共服务理论等为理论基础，采用案例研究法、文献法、访谈法、比较法等研究方法，针对目前国内外政府门户网站管理绩效评估的现状和绩效评估指标设定存在的问题，分析平衡计分卡和关键绩效指标这两个理论工具在政府门户网站管理绩效评估中的可行性和优势。通过对平衡计分卡和关键绩效指标原有框架、维度、设计层面进行调整，借鉴国内外现有的指标体系成果，理顺指标之间的因果关系链，重新进行指标选择，建立起基于平衡计分卡的政府门户网站管理关键绩效指标。并运用建立起来的评估指标对“中国苏州”政府门户网站管理部门进行绩效评估，指出问题及成因，提出改进建议。