本研究以国际公认的抗西瓜枯萎病生理小种1的西瓜品种“卡红(Calhoun Gray)"为材料,取接种西瓜枯萎病菌0、6、12、24、48、72h的根尖组织,提取总RNA,混合后分离纯化mRNA,合成cDNA作为测验方(Tester),以接种蒸馏水的对照为驱动方(Driver),构建了受西瓜枯萎病菌胁迫响应基因的SSH-cDNA正向文库,分析EST序列,并利用RT-PCR技术分析抗病相关基因的表达特性。获得的主要结果如下：1、总RNA中28S条带的亮度约为18S的两倍以上,A260/A280值介于1.8～2.0；双链cDNA呈弥散状且分布在0.2～4kb；酶切后片段为0.1kb～4kb,主要分布于200bp～750bp;抑制消减杂交后差异片段为150bp～800bp,集中于500bp左右；克隆效率达80%以上。构建了包含1400余个克隆的抑制消减杂交正向cDNA文库。2、随机挑取部分克隆,利用reverse Northern dot-blot进行假阳性验证,结果表明85%以上的克隆为阳性表达基因,达到文库的标准。3、随机挑取300个阳性克隆测序,得到259条高质量的EST序列。经BLAST同源性比对,167条EST有功能已知的同源序列,占全部ESTs的65.5%,有92条无相关匹配结果,功能未知。其中与抗病、防卫相关的有64条23种,占24.7%。同源基因所代表的基因涉及编码蛋白包括抗病信号蛋白、抗病蛋白、HR(hypersensitive reaction)和SAR(Systemic acquired resistance)相关蛋白、转录因子、防御反应和次生代谢合成相关蛋白、植物细胞保护蛋白等。4、根据文库中得到的过氧化物酶和水通道蛋白基因序列,利用RT-PCR技术分析了在接种枯萎病后过氧化物酶、水通道蛋白在根系中的表达情况,结果表明过氧化物酶和水通道蛋白都呈现为上调表达,推测过氧化物酶和水通道蛋白与西瓜品种“卡红”的抗枯萎病相关。