博士后流动站是国家培养高层次人才的一个重要基地，在提高我国博士后培养和使用质量、促进科研活动服务于社会主义现代化建设的过程中，起着重要的作用。为了使各个流动站明白自己所处的位置、所具有的优势和不足，准确合理的给自己定位；为了给流动站的建立和评价提供一些依据，今后更好地开展流动站评价工作；对流动站进行绩效评价是非常必要的。 本文在前人研究的基础上，依据现有的研究理论和成果，针对流动站评价工作中存在的问题，从流动站绩效评价的内涵、特点、目标和原则等着手，基于平衡计分卡思想，从财务、客户、内部流程和学习与成长四个维度构建了流动站绩效评价指标体系，使平衡计分卡的应用研究扩展到了非营利组织，然后通过各种评价方法的对比、分析，采用层次分析法和熵值法相结合的方法建立了流动站绩效综合评价模型。 另外，本文在收集了若干流动站实际数据的基础上，应用所建立的综合评价模型进行实证研究，通过对评价结果的分析，评价结果符合客观实际，验证了该评价模型的正确性和实用性，运用该模型对流动站绩效进行综合评价是完全可行的。 本文所建立的流动站绩效综合评价模型，能够对流动站的绩效做出合理的评价，以便流动站及时了解绩效现状、采取措施，达到提高流动站绩效的目的，因此，该模型对流动站绩效评价工作具有实践意义。