保税区是我国开放度最高的海关监管特殊经济区域。保税区通过引进外资和先进技术不仅实现了扩大出口、增加外汇收入、创造就业机会和促进区域经济发展的设区目标，而且在发展过程中促进了区内产业结构的升级。然而，随着我国关税总体水平的逐步降低，保税区与区外的关税落差逐渐减小、削弱了保税区的“保税”优势，而国家贸易经济权的逐步放开也减弱了保税区凭借特殊政策形成的国际贸易优势;另外，保税区在发展过程中有许多问题亟待研究解决。　　本文首先在第二章对保税区、出口加工区、自由贸易区等相关概念进行界定，并重点对保税区与出口加工区、自由贸易区进行比较分析;第三章首先综合运用国际经济学、区域经济学等相关理论讨论了保税区存在和发展的理论基础，并在总结出保税区运作模式的基础上，采用博弈论等方法进一步对保税区的成本效益、东道国和跨国公司在保税区博弈中的纳什均衡进行系统分析。第四章分析了我国保税区的发展历程和加入WTO后保税区存在的必要性和发展趋势，并总结出当前保税区发展中存在的问题和发展瓶颈。第五章详尽分析了港区一体化的优势，并结合对自由贸易区的优势分析提出我国保税区应按照“区港联动”——“区港一体化”——“保税港区”——“自由贸易区”的方向逐步转型发展的结论。最后文章又对现有保税区的调整和改革进行了分析作为补充。