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本文通过序列分析在拟南芥基因组中鉴定了69个逆转座基因。它们大多数来自成熟的mRNA,其中20个逆转座基因还残留着逆转录过程的痕迹,有22个逆转座基因是程序化形成的假基因(processedpseudogene),有55个逆转座基因是转录的,特别趋向于在顶端分生组织的根和花中表达。对这些逆转座基因的功能组成分析显示它们的祖先基因的逆转座化可能不是由于它们本身的基因功能特征,而可能是因为它们在配子细胞中的高表达为逆转座提供了合适的模板。通过判断某些逆转座基因的存在与否,还可以为生物地理研究提供进化分枝上的标签。
本文根据最新产生的两个逆转座基因(At1g61410andAt5g52090),我们分析了人类活动和地中海更新世避难所(MediterraneanPleistocenerefugia)对拟南芥生物地理分布的影响。我们的研究表明,通过逆转座作用产生新基因的速度是每百万年0.6个基因。逆转座子可以作为它的祖先基因早些时候表达的分子化石。在植物转录体进化上,这些表达的祖先基因表现出了3’非翻译区延长的趋势。此外,我们鉴定了一个植物功能嵌合的基因,它发生逆转座后通过捕获两个外显子,获得了细胞内区间相互运输的功能。