微生物是生态系统的重要组成部分,在生态系统的物质循环、能量流动的各个环节都发挥着十分重要的作用。本论文以南四湖流域七星湖这一典型近自然库塘湿地为研究对象,采用分子生物学技术对秋季水体和底泥中的微生物进行研究,从微生物的种类组成和多样性与主要水质指标的相关性入手,探讨了微生物在水质净化过程中与主要水质指标的相互作用关系。结果表明,在水体中,微生物在上、下游分别形成了与污染负荷、污染物削减强度相适应的物种组成结构；多样性变化受到环境因素的综合影响,与单一因素的相关性不显著,微生物多样性对水质有一定的指示作用；水体中检测到的β-变形菌门、裸藻门和拟杆菌门物种对水质有较好的指示作用。在底泥中,10月份开阔水域微生物多样性高于植物根际微生物,11月份两个区域多样性接近,2个月份中芦苇根际微生物多样性变化较小,但香蒲群落11月份有所下降；10月份开阔水域、芦苇根际和香蒲根际微生物群落结构区域之间差异明显,11月份差异较小,相邻截面的群落结构比较相似；在开阔水域,与氮去除有关的6-变形菌门微生物11月份逐渐消失,导致氮去除效率降低,是底泥微生物群落结构变化和多样性降低的主要原因；在植被区,10月份和11月份与氮去除有关的微生物分布较少,个体数量差别较小,但与芦苇和香蒲有共生关系的绿弯菌门、拟杆菌门、浮霉菌门微生物稳定存在,能有效分解有机物释放无机态氮、磷。在整体上,水体微生物的组成结构和多样性变动较大,底泥微生物与水质指标间的相互作用关系要强于水体中的微生物,在氮、磷的去除过程中发挥重要作用。本项研究揭示了水质改善过程中微生物物种组成、多样性及种类的变化情况,为同类型水处理系统的研究应用提供理论参考。