本文以合并高校内部会计控制为研究对象，详细分析了目前我国合并高校内部会计控制现状，对合并高校内部会计控制系统进行定义，并对合并高校内部会计控制系统的目标和功能进行了全面的剖析。以此为导向，以系统论、控制论、为理论基石，构建了合并高校内部会计控制系统的理论框架，并在此基础上进行了对A大学内部重点领域会计控制的实证设计。本文在合并高校内部会计控制系统方面进行了深入的研究和积极的探索，希望为合并高校内部会计控制系统的理论研究和实践做出一些贡献。　　 本文主要结论有以下几点：　　 (1)通过对A大学内部会计控制现状的分析，可以看出合并高校内部会计控制系统的建设和完善是刻不容缓的。由于高校普遍缺乏内部会计控制意识，高校管理层对内部会计控制不够重视，致使高校财产安全存在很大的风险和隐患。近几年，随着我国教育改革的深化，高校呈现生机勃勃的景象，高校的高速发展迫切需要科学的管理系统，提高合并高校内部会计控制水平是提高高校管理水平的一个重要途径。　　 (2)通过对合并高校内部会计控制系统目标分层理论的论述和剖析，得出结论是合并高校内部会计控制系统建设是一个循序渐进的过程。合并高校内部会计控制系统的构建不是一蹴而就的，而是由简单到复杂、由不完善到完善逐渐发展的。因此，建立合并高校内部会计控制系统是一个具有长期性、连续性和阶段性的过程。　　 (3)通过对A大学内部重点领域会计控制的实证设计，以“三论”为理论基础构建的合并高校内部会计控制系统不但具有约束和激励的功能，同时应具备自我调节、自我优化的功能。构建良好的高校内部会计控制系统，不但可确保高校财产的安全与完整，而且可不断优化控制坏境、提高高校教职员工的内控意识，间接地提高控制系统的目标层次，提升内部会计控制系统的功能。