在科学技术突飞猛进的知识经济时代，创新是推动经济与社会发展的重要支撑。博士研究生教育作为我国高等教育的最高层次，是未来知识经济时代的中坚力量，其创新能力不仅直接影响到高等学校知识创新的水平，也关系到国家未来的整体创新能力。随着我国博士生教育的发展，博士生培养质量有了一定的提高，但从整体上来看，我国博士生的创新能力与其他发达国家的博士生相比还有相当的距离，究其原因，是在目前的博士研究生教育中还存在着许多与培养创新能力不相协调的因素，这些因素的存在限制着博士生创新能力的培养，亟待解决。 本文以博士生创新能力培养的整个过程为研究对象，首先对创新和创新能力进行了界定，对我国的博士生创新能力的现状进行了阐述和分析，并对相关的文献和资料进行了梳理，在此基础上对目前我国博士生生源质量、课程教学、导师队伍、科学研究、学位论文等方面的现状进行了详细的分析，指出了其中不利于博士研究生创新能力培养的方方面面：选拔方式过于看重初试成绩的作用，以二三流大学毕业生为主的博士生生源结构，使得博士生创新能力培养缺乏后劲，对博士生课程教学重视不够，使得课程教学质量不高对创新能力培养缺乏理论根基和方法指导，国家科技经费投入不足，使得科学基础研究条件欠缺是制约博士生创新能力培养的根本性原因，博士生规模增长过快而相关的配套措施没跟上，使得导师整体学术水平不高和指导不足是影响博士生创新能力提高的第一要素，而高校自身的“松”与“乱”则是造成博士生考核机制不完善，使得博士生对自身创新能力的提高缺乏动力，然后，分别针对这些存在的问题就提出了一些有益的建议与对策。 在分别对影响博士生创新能力培养的五个方面进行了分析并提出对策后，考虑到博士生创新能力的培养是一个系统工程，系统中单个要素的提高并不能够从整体上改变我国博士生创新能力培养的水平，因此本文从系统论的角度出发对影响博士生创新能力培养的五个方面之间的关系以及各个方面对创新能力培养的作用进行了分析，最后以整体的和动态的视角对如何优化培养流程和整合培养环节各个要素提出了建设性的看法和建议。