我国高等教育规模逐步扩大,对资金的需求也越来越多,但国家财政所投入的经费是有限的,如何提高高校自身的预算管理能力,使高校资金使用效益最大化,是目前高校亟需研究和解决的问题。目前我国大部分高校实行“二级管理,院为基础”的管理模式,这种模式,使得作为高校二级教学单位的学院成为重要的权责实体。作为高校教育教学的工作核心,高校二级教学单位预算规划和管理能力的提高是提高高校资源配置效率的基础,也是高校预算管理改革的基础和重要组成部分。然而,目前大部分高校二级教学单位的预算管理还面临着许多问题,如没有建立起预算的绩效评价体系、绩效评价的指标设计不尽合理等。因而未能对自身使用教育资源的效果进行科学有效的评价,资源的使用效率较低,进而影响了整个高校的资源配置效率和战略规划。基于以上认识,本文对高校二级教学单位预算的绩效评价问题进行了研究,先是对预算以及预算的绩效评价的相关理论以及法律政策进行了研究,明确了对高校以及高校二级教学单位的预算实施绩效评价的法理基础。接着对我国高校预算管理的现状及存在的问题进行了分析,阐述了高校以及高校二级教学单位对预算实施绩效评价的必要性,并以A大学为研究案例,深入分析了A大学及其二级教学单位的基本情况,并对其二级教学单位实施预算的绩效评价的情况及不足进行了剖析。并从绩效评价的构建原则,评价指标的选取以及各项指标权重的确定对A大学二级教学单位预算的绩效评价指标体系进行了构建。最后提出了相应的配套措施以保障A大学二级教学单位预算的绩效评价能够顺利开展。