当今知识经济社会技术发展速度迅猛,社会中的各行各业甚至是国家之间的竞争都是十分激烈的,此时技术创新就成为了重要的手段,企业要想发展就必须进行创新,提高自身的研发投入,增强企业的竞争力。伴随着互联网、大数据、区块链的高速发展,我国企业创新也迎来了新的机会,研发投入有助于提高我国企业的综合实力。但研发活动本身具有周期性长、风险性高、资金需求较高的特点,当企业进行研发活动时需要大量的资金,并且这种资金风险性要远远大于其他投资活动的风险,再加上受到融资约束的影响,企业想从外部获得研发资金难度是非常大的,这就需要我们在企业内部储备充足的自由现金流。同时,在两权分离公司治理机制下,也会出现委托代理问题,股东与经营者之间利益目标不同,从而导致经营者为了获得较高的薪酬而规避研发风险,减少企业研发的投入,影响公司的长远利益。而股权激励就是缓解代理问题的有效手段,股权激励能够让委托人和代理人之间的利益目标趋于一致,有利于企业的长期发展,提高企业自身价值。目前直接研究这三者之间的关系的文献并不是很多,大多数都是研究股权激励与研发投入、自由现金流与研发投入之间的关系,但很少有将自由现金流引入到股权激励与研发投入之间的关系的研究中。本文首先对国内外有关股权激励、自由现金流、研发投入相关的文献进行了回顾与整理,然后基于委托代理理论、信息不对称理论、股权激励理论、技术创新理论等理论基础,分析了股权激励、自由现金流对企业研发投入的影响,并进一步梳理了股权激励、自由现金流、企业研发投入之间的关系,在此基础上,提出本文的研究假设。本文以沪深A股上市公司(剔除了金融类、ST、*ST)的数据为研究样本,研究了股权激励、自由现金流与研发投入之间的关系。经过研究,本文的主要研究结论有如下几个方面:(1)股权激励能够对研发投入产生正向促进作用。即股权激励越大企业研发投入越大。(2)自由现金流与研发投入显著正相关,即当企业内部的自由现金流水平越高时,企业研发投入也会越高。(3)自由现金流会对股权激励与研发投入之间的关系产生影响,自由现金流水平较高时,股权激励对研发投入影响增大。本文的研究结论丰富了自由现金流、股权激励和研发投入之间关系的理论研究。本文最后对企业股权激励有效实施及企业资金管理给出了相关的建议,以期有助于提高企业的科技创新水平,增强企业的竞争优势。