生态补偿被广泛应在我国各重点资源领域的保护上,通过政府补偿的手段来保护生态环境与自然资源的重要政策手段,其中森林资源领域的生态补偿在国内实施范围最广、时间最长。森林资源生态系统问题在我国一直是政策和研究关注的重点。我国开展重点林业建设工程已有二十余年,如何实现环境投入不是无效投入,体现环境投入的可持续性,体现资金的使用效率,如何让生态补偿,特别是森林生态效益补偿的投入资金实现向效益型的转变,充分发挥其协同生态和经济可持续发展的作用,需要有效的外部监督机制。因此,如何发挥审计的监督管理职能,将审计运用在对森林生态效益补偿政策实施成效上,在理论和实践方面都具有重要研究意义。然而现阶段我国森林生态效益补偿的审计工作存在审计重点资金的使用绩效问题,缺少从森林生态质量方面作为审计视角,全面审计该补偿政策在生态和社会方面的效益。笔者首先对我国生态补偿以及森林生态效益补偿三十年的政策发展历程及政策相关内容进行了梳理,其次对我国2007年至2020年间森林生态效益补偿开展的审计工作从审计目标、审计内容等方面进行了总结,发现我国森林生态资源补偿政策的当前正处于以生态恢复为优先的阶段,并提出生态要与经济和社会共同发展。进而,笔者在当前审计现状的基础上,结合森林生态效益补偿政策实施情况,以外部性理论、公共受托责任理论以及委托代理理论为理论基础,提出了森林生态效益补偿绩效审计的完善思路,即森林生态效益补偿的绩效审计应以该补偿项目的生态效益为主要审计目标,以审计评价补偿项目的生态效益、经济效益与社会效益为审计内容,结合“三生”共赢理论构建了包含生态效益、经济效益和社会效益的绩效审计指标体系,形成了本研究的森林生态效益补偿绩效审计框架。最后,以Y保护区内实施森林生态效益补偿为案例展开了例证分析,案例分析的结果表示:在Y保护区的森林生态效益补偿实施效果表现不佳。Y保护区的森林生态效益补偿项目的投入没有在当前得到与该投入相适应的产出,在生态、经济和社会三个方面均表现出规模报酬递减。综上,得出以下结论:（1）投入产出效果不佳。在2014年至2018年期间,保护区内的森林生态效益补偿政策资金投入与巡护人力投入在保护当地森林资源生态环境上效果不佳。（2）政策作用下的效益表现差异较大。一是体现在森林生态效益补偿政策作用下,生态、经济和社会三方面产生的效益结果差异较大;二是体现在,在同一政策作用下,在生态、经济和社会三方面表现上,保护区南北两个片区的差异性较大。进而笔者分别从提高经济效益、生态效益和社会效益三个方面提出了对策建议。同时,对完善森林生态效益补偿绩效审计从加强立法、完善绩效审计指标及审计数据信息、扩充审计人员队伍建设三方面提出了相关建议。