【摘 要】
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塞尼卡病毒（Seneca valley virus,SVV）会造成猪的口鼻和蹄壁出现溃疡性病变,给养猪业造成了巨大的经济损失。近年来塞尼卡病毒病呈零星散发趋势,虽然长链非编码RNA（long non-coding RNAs,lncRNA）已被证明在调节免疫反应方面发挥重要作用,并对多种生物学过程产生深远影响,但lncRNA在SVV感染宿主的过程中发挥的作用仍不清楚。因此,有必要深入探究lncRNA
【基金项目】
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国家自然科学基金（31802195）；
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塞尼卡病毒（Seneca valley virus,SVV）会造成猪的口鼻和蹄壁出现溃疡性病变,给养猪业造成了巨大的经济损失。近年来塞尼卡病毒病呈零星散发趋势,虽然长链非编码RNA（long non-coding RNAs,lncRNA）已被证明在调节免疫反应方面发挥重要作用,并对多种生物学过程产生深远影响,但lncRNA在SVV感染宿主的过程中发挥的作用仍不清楚。因此,有必要深入探究lncRNAs与SVV之间的联系及SVV的病毒特性。为了探索宿主lncRNA与SVV之间的关系,本研究以SVV感染的ST细胞为模型,应用RNA-seq技术首次分析了SVV感染后ST细胞的lncRNA及mRNA表达谱。本文鉴定出1332条lncRNAs和3299条mRNAs差异表达,并通过GO和KEGG对差异表达lncRNAs进行了功能分析。本文构建了lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络,将lncRNA与在病毒与宿主相互作用中发挥重要作用的miRNA和mRNA联系起来。为更好地理解宿主lncRNAs与SVV之间的联系和SVV的发病机制提供了基础。本研究通过qRT-PCR对RNA-seq数据进行了鉴定,并对lnc-MSTRG.18940.1进行了深入研究,发现SVV能够显著上调MSTRG.18940.1的转录并呈现剂量依赖性。通过siRNA和shRNA对lnc-MSTRG.18940.1进行基因沉默后可以显著抑制SVV的感染。lnc-MSTRG.18940.1 沉默同样可以抑制 IL-1β、IL-6、IL-8、IL-12 和 TNF-α的表达,起到抑制炎症反应的作用。本研究为进一步探究lncRNA在SVV感染过程中的调控作用提供了新的方向。本文通过合成SVV毒株CH-FJ-01的病毒全基因组并克隆到pcDNA3.1+上,建立了 CMV-T7联合启动子类型的克隆。通过PCR及测序对拯救的病毒进行鉴定,并且在ST细胞上传代获得稳定的病毒后绘制病毒增长曲线,为后期探究SVV病毒特性和疫苗研究提供研究基础。
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