蜕皮激素诱导的丝腺相关基因表达研究

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在实时荧光定量PCR中一般采用各种不同的管家基因作为内源参照基因对目的基因进行校正,以消除不同样本在RNA产量、质量以及逆转录效率上可能存在的差别。理想的内参基因应在各种实验因素条件下,各种类型的组织或细胞中均恒定表达。然而,大量的研究结果表明,内参基因的表达并不稳定,如果没有合适的标准化处理,盲目地使用某一管家基因作为内参,可能导致错误甚至相反的结论。本文按照MIQE规则检测了家蚕7种常用内参基因(Actin3、GAPDH、28SrRNA、RPL3、α-Tubulin、UBC和TBP)正常条件下的不同发育时期及蜕皮激素诱导条件下在不同组织的转录表达水平,并利用标准化分析软件geNorm和NormFinder进行稳定性分析,找到了不同实验条件下在不同组织中相对稳定表达的基因。利用筛选出的内参基因检测了Fib-H,Fib-L,Fmbp-1和SGF-1基因在家蚕后部丝腺,P25,Ser-1,SGF-1和Fmbp-1基因在中部丝腺,Fib-H,Fib-L,SGF-1和Fmbp-1基因在脂肪体组织中的转录水平变化,通过比较组织间的转录水平,分析蚕体组织以及Fib-H、Fib-L、P25、Ser-1、SGF-1、Fmbp-1基因在蜕皮激素诱导后的表达调控特征。研究结果如下:1.正常条件下内参基因的稳定性采用RT-PCR检测了7种内参基因在家蚕五龄第一天至第七天的表达水平,然后使用内参基因稳定性分析软件geNorm和NormFinder对内参基因的稳定性进行评估。软件分析结果显示在不同组织中相对稳定的基因是不同的,其中α-Tubulin、GAPDH在中部丝腺,GAPDH、UBC在后部丝腺,α-Tubulin、UBC在脂肪体组织中表达相对较为稳定。2.蜕皮激素诱导刺激条件下内参基因的稳定性使用geNorm和NormFinder软件分别对候选的7种内参基因在20E诱导条件下五龄第2天0至72h的表达水平进行评估。其中内参基因α-Tubulin、28SrRNA在中部丝腺,GAPDH和28SrRNA在后部丝腺,α-Tubulin和UBC在脂肪体中的表达相对稳定。3.蜕皮激素诱导后Fib-H、Fib-L、P25、Ser-1、SGF-1和Fmbp-1基因的组织转录水平分析蜕皮激素诱导后Fib-H,Fib-L,P25,Ser-1基因在后部丝腺、中部丝腺中的表达量都有不同程度的降低,表明家蚕五龄幼虫早期阶段外源添食蜕皮激素对于Fib-H,Fib-L,P25和Ser-1基因表达有一定抑制作用。SGF-1和Fmbp-1基因在蜕皮激素诱导后在后部丝腺、中部丝腺中的表达量分别在不同的时间点出现了升高,表明蜕皮激素可以促进SGF-1和Fmbp-1基因的表达。丝蛋白基因的表达有众多的调控因子,关于表达调控的复杂网络还有待于进一步研究。本研究按照MIQE规则对家蚕常用的七种内参基因在正常条件下的不同发育时期及蜕皮激素诱导条件下在不同组织中的稳定性进行分析,研究发现,在不同实验条件下,不同组织中最稳定的内参基因是不同的。在实时荧光定量PCR实验中,内参基因的选择是很重要的,要根据具体的实验进行选择,盲目地使用某个基因作为内参基因目的基因的表达将会被误导,为研究家蚕功能基因组织转录水平的定量分析法提供一定的指导意义。
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