基因调控网络（Gene Regulatory Network,GRN）是基因之间相互调节形成的复杂网络。肿瘤细胞往往会表现出不同于正常细胞的转录状态,呈现GRN特异性。因此,鉴定和分析肿瘤特异GRN,对癌症的诊断和治疗有着重要的科学价值。本文收集了TCGA数据库中33种不同肿瘤的基因表达数据,通过生物信息学的手段,鉴定到一些与癌症紧密相关的转录因子及调控网络:通过对比不同肿瘤组织的GRN,我们鉴定出25个在泛癌中高度保守和16个调控网络差别极大的转录因子。通过对比各肿瘤与其癌旁组织,鉴定出60个肿瘤特异GRN,重点探讨了RELA基因相关GRN。这些特异GRN或可为癌症的诊断提供新的标志物。此外,我们还基于大规模单细胞RNA测序数据系统分析了不同条件下GRN在单细胞层面的特征和功能,发现不同的细胞亚型有着各自特异的GRN。例如,通过分析非小细胞肺癌细胞的单细胞RNA测序数据,我们在CD8+、CD4+Treg和CD4+Tconv三类免疫细胞中分别鉴定到了6、4、2个特异的GRN。鉴于基因调控网络的重要性,我们基于TCGA、GTEx、GEO等公共数据平台收集184个不同生理病理条件下的基因表达数据,构建了免费的基因调控网络数据库GRNdb（www.grndb.com）,以方便广大研究工作者进一步剖析不同条件下的GRN。数据库目前包括143个人类不同正常和疾病组织,涉及近1700万对转录因子-靶基因作用对,41个小鼠正常组织,涉及近280万转录因子-靶基因作用对。通过GRNdb数据库可以方便直观地查询和分析不同基因在不同条件下的调控关系和表达状态等。总的来说,我们系统解析和研究了各种肿瘤细胞中的GRN,并鉴定到一些肿瘤中共有和特异的GRN。我们还剖析了GRN在细胞分型中的作用,并构建了GRNdb数据库以期促进基因调控网络研究领域的发展。