论文部分内容阅读
目的分析和对比功能性消化不良(functional dyspepsia,FD)患者与健康对照者(healthy control,HC)唾液中菌群的差异,探讨FD不同亚型和焦虑状态对唾液菌群组成的影响,筛选出与疾病状态相关的特征性菌群。方法收集68例FD患者及47例HC的唾液标本,每个入组者均填写GAD-7(generalized anxiety disorder-7,GAD-7)焦虑量表,并计算得分。依据罗马Ⅲ标准和GAD-7量表分值,从中选出40例FD患者,包括餐后不适综合征(postprandial distress syndrome,PDS)和上腹痛综合征(epigastric pain syndrome,EPS)各 20 例。伴焦虑状态(anxiety-positive functional dyspepsia,FD.P)和不伴焦虑状态(anxiety-negative functional dyspepsia,FD.N)各20例。HC组20例。提取唾液中的总基因组DNA,采用Illumina高通量测序技术对样本中所有细菌的16S rRNA-V4区进行DNA测序,并进行包括操作分类单位(operational taxonomic units,OTUs)、Alpha 多样性、Beta 多样性等生物信息学分析,并获得各组之间的差异性细菌。所有入组者均无幽门螺杆菌(helicobacter pylori,Hp)感染。结果FD组唾液中菌群在门水平以变形菌门、拟杆菌门为主,属水平以奈瑟菌属、梭杆菌属为主。EPS组和PDS组、FD.P组和FD.N组菌群结构在门及属水平与FD组相似,即以变形菌门、拟杆菌门、奈瑟菌属、梭杆菌属为主。从Chaol、ACE、Shannon等alpha指数及稀释曲线等分析,提示各分组的丰度及多样性较合理。但FD组、EPS组、PDS组唾液菌群的Alpha指数与HC组相比没有明显差异。FD.P组菌群丰度较FD.N组和HC组明显减少,多样性则没有明显差异。采用LEfSe(linear discriminant analysis effect size tool,LEfSe)分析筛选组间有显著差异的菌群。FD与HC组之间有差异菌群共有13个,包括拟杆菌门、普式菌属、韦荣氏球菌属、γ变形菌、变形菌门、巴氏杆菌科等,其中5种在FD组富集。PDS组和EPS组两组间特异性的菌群有γ变形菌、巴氏杆菌科、巴氏杆菌目,但仅在PDS组富集。PDS组和HC两组间特异性的菌群有8种,包括变形菌、巴氏杆菌科、拟杆菌门等,其中5种在PDS组富集。EPS和HC两组间特异性的菌群有7种,包括韦荣氏球菌属、韦荣氏球菌科、普氏菌属等,仅在HC组富集。FD.N组与HC组有差异的菌群有12种,包括拟杆菌门、普氏菌属、韦荣氏球菌科、巴氏杆菌科、β变形菌、变形菌门等,FD.N的优势菌群有5种。FD.P组与HC之间有差异的菌群共有4个,包括链球菌科和链球菌属等。FD.P组与FD.N组之间未发现有差异性的菌群。结论与HC相比,FD患者唾液菌群以变形菌门,HC以拟杆菌门为主。FD不同亚型发现有其特征性菌群,PDS特征性的细菌包括变形菌门、γ变形菌、巴士杆菌科等,EPS未发现有特征性菌群。FD患者伴或不伴焦虑状态也发现有特征性菌群,FD.P组唾液中特征性的细菌为链球菌科和链球菌属,FD.N组唾液中特征性的细菌为变形菌门、Y变形菌、β变形菌、巴氏杆菌科、巴士杆菌目,研究初步提示了菌群组成与FD症状和情绪状态有联系。