我国农村基层党组织作为党基层组织的重要组成部分，其作用发挥得如何，直接关系到党的路线、方针、政策在农村的落实，关系到农村经济和各项社会事业的发展，关系到广大农民根本利益的实现。党的十七大明确指出，要“使党的工作和党的建设更加符合科学发展观的要求”，为此，牢固树立与科学发展观相一致的理念，在农村基层党组织建设深刻全面的贯彻落实科学发展具有重大的意义。本文纵观改革开放以来我国农村基层党组织建设的发展历程，分析每个时段农村基层党建的特征以及相关文献，对农村党建的思想政治建设、组织建设、作风建设、制度建设以及党风廉政建设五个基本内容进行了具体的阐述。科学发展观作为本文的贯穿线，第一要义是发展，核心是以人为本，基本要求是全面协调可持续，根本方法是统筹兼顾。从科学发展观的角度探析我国农村基层党组织建设具有重要意义，用科学发展观引领我国农村基层党组织建设是我党永葆先进的具体体现，是党组织充满生机和活力的重要源泉，是实现农村工作跨越式发展的根本保证。当前我国农村基层党组织建设固然也存在一定的问题，思想建设薄弱、组织建设滞后、制度建设不健全、党风廉政建设力度不够等问题都是与科学发展观不相适应的。同时，探寻我国农村基层党组织建设存在问题的原因是科学指导农村党组织建设的中重要前提。本文通过对农村自身发展的特殊性、改革开放以来给农村基层党组织建设带来的新挑战、新矛盾等方面的分析，提出了以科学发展观为指导加强我国农村基层党组织建设的对策。科学发展观作为我党的重大战略思想，坚持科学发展观指导我国农村基层党组织建设是推进我国农村党组织建设改革、谋划我国农村党组织建设发展的根本依据。2012年是基层组织建设年，我国党的基层组织半数在农村，没有农村基层党组织建设的加强，就没有全国基层党组织建设的加强。文章从科学发展观的主要内容，提出了加强我国农村基层党组织建设的科学对策。必须坚持以人为本的核心、全面建设可持续发展的目标、统筹兼顾的方法来指导我国农村基层党组织建设。