回鹘文《金光明经》是目前已知现存的篇幅最大的回鹘文文献,其中圣彼得堡保存的版本最为完整,柏林收藏的出土于我国新疆的版本多为残片,据拉施曼的《回鹘文〈金光明经〉编目》,柏林本残片至少有70个版本。其他残片散见于英国、瑞典以及我国等地。柏林本与圣彼得堡本相比,在内容方面大多保持一致,但也存在不少异文以及较为特殊形式的文本。这些为我们对勘比较各个文本提供了丰富的材料。在圣彼得堡本回鹘文《金光明经·分别三身品》中,有多个片段较为集中地反映了唯识宗思想的影响。第一个片段是对于三身的注释,无汉文对应,其中反映了以《成唯识论》为主的唯识宗经典所使用的名相。并且,这一片段与Pelliot ouigour 16的《菩提行道》存在极为相仿的内容。两者可能有共同的底本,这一底本很可能是以《成唯识论》等唯识宗经典为基础形成的改译本或是佛教类书。第二段是关于法身特征的描述。汉文本使用颇有空宗思想的“中道”来描述法身,而圣彼得堡回鹘文本则避免用“中道”作为对法身的描述。第三段是关于菩萨修行十地所除“十障”的内容。这段内容圣彼得堡回鹘文本与汉文本出现了很大的偏差,这是由于回鹘文本用五位百法、与唯识宗所立十地相配的十障、十波罗蜜、十真如等等名相进行的改译。柏林本残片U 2579是关于“十障”的残片,其使用的术语与圣彼得堡本完全不同,但与汉文本的术语贴合。结合唐代吐鲁番和敦煌地区存在唯识宗传播的事实,圣彼得堡本可能代表了受唯识宗影响的版本,这一版本为胜光法师所译;而U 2579为代表的版本,则代表了更贴合于汉文本的版本。