N-（0，0-二异丙基）磷酰化氨基酸在水中会发生显著的磷脂水解，水解后主要得到脱掉一个烷氧基的水解产物，随后发生去磷酰化反应到达最终产物磷酸单脂。水解可能经历了五元环状的五配位磷中间体的过程，而不是直接发生水解，五配位磷中间体在自催化水解反应中起着重要作用，实验已证实五配位磷类似物的存在。本研究工作使用Gaussian 03W进行了N-磷酰化氨基酸分子内成环催化水解和去磷酰化反应机理的理论计算，讨论了分子内成环后水解，然后开环的过程，计算了去磷酰化的步骤。计算结果显示，发生成环后的五配位磷中间体容易水解，而且水解产物容易发生去磷酰化反应而得到最终产物，对N磷酰化氨基酸成环后水解和直接水解的两种不同反应路径进行了计算，从两条反应路径的能垒看，五元环状五配位磷中间体比反应物分子更有利于水分子亲核进攻，分子内成环后水解的反应历程比直接水解容易进行，从而在理论上验证了水解过程可能经历了五配位磷中间体过程的推测。运用Gaussian 03W对从白英全草的正丁醇萃取相中分离得到的（E）-N-（4-氨基正丁基）-3-（3-羟基-4-甲氧基-苯基）丙烯酰胺的稳定构象和顺反异构化过程进行了理论研究。寻找其顺反构象异构化的过渡态，计算得到了顺反异构化的势垒，并进行了统计热力学分析，揭示其在常温下反式和顺式异构体可迅速转化，但顺式异构体占绝大部分。在B3LYP／6-311+G（2d，p）水平上用GIAO方法计算两种异构体的¹H和¹³C NMR的化学位移，使用Origin软件对对理论计算值与实验值进行统计分析和比较，显示顺式构象的计算值与实验值较为接近，进一步证实了理论推断的正确性。随着计算机软件技术的发展，许多针对化学领域的软件被开发出来，像众所周知的ChemOffice，ChemSketch，Gaussian等，针对现在在普通化学实验室越来越多的需要用到这些软件的具体情况，开发了一套常用化学软件的网络多媒体教学软件。该多媒体教学软件所教授的包括化学绘图软件ChemDraw 8.0、ChemWindow 6.0 Spectroscopy版和ACD／ChemSketch 8.0，著名量子化学计算软件Gaussian 03W和它的图形化界面GaussViewW3.0、HyperChem 7.5，以及数据分析和绘图软件Origin 7.5。