日本汉方医学源于中国，是以传统中医学为基础在日本发展而成的医学。但现代日本汉方医学与中医学有着较大的差异，其中差异最大的是日本汉方医学“轻理论，重方术”。本文采用文献学研究和比较研究方法，通过回顾中日医学交流史、日本社会发展史、文化主导者的变迁史等，对日本汉方医学“轻理论，重方术”之思路形成的历史背景、源流等进行了探讨。认为，在明清以前，中医学中的阴阳五行学说、脏象经络学说等理论在汉方医学中都占有极其重要的地位，与当时的中医学无明显的差异，只是由于后世社会环境的改变、文化主导者的变迁以及梅毒等传染病的流行，以致过分地重视“实证亲试”，强调“万病一毒”，力主“方证相对”等，使之逐步走向“轻理论，重方术”之路，放弃了中医学“辨证论治”的原则，其中影响最大的是吉益东洞。文中分析了日本汉方“轻理论，重方术”的流弊以及对日本汉方医学现状的影响，并以“小柴胡汤副作用”为例，指出日本汉方医学的优势、局限以及对策。