随着国民经济的发展和科技兴国战略的实施，我国高校进入了前所未有的发展机遇。教育体制的改革，高校经济活动的复杂化和资金来源的多样化，对高校财务管理提出了更深一步的要求。而高校因内部控制失控而导致的事故不断的发生。2008年6月，财政部、银监会、保监会、证监会、审计署五部委联合发布了《企业内部控制基本规范》，这是我国企业内部控制理论进入了一个全新的发展的标志时期，2012年11月，财政部首次印发了《行政事业单位内部控制规范（试行）》为进一步提高行政事业单位内部管理水平、规范行为及防范风险机制做了具体规定。　　本文从国家加大对高校资金投入、高校债务化解经济状况好转、政策法规的完善及建立现代大学管理体制入手，提出了加强内部控制是时代发展的要求。首先介绍了内部控制的概念、目标、发展历程和理论基础，以湖南省属本科高校为例，参照《行政事业单位内部控制规范（试行）》分别从单位层面和业务层面着手设计了调查问卷，通过现场和网络问卷发放，得到样本高校关于内部控制有效性的基础数据。首先对数据进行描述性统计分析，然后以调查数据的平均得分，众数及方差为基础，进行聚类分析，得出样本高校内部控制的三种状态，然后对内部控制失效的情况提出重点关注并剖析原因，最后对样本高校的内部控制失效提出建议。