随着经济社会的发展,国民对教育的需求越来越大,作为高等教育大众化的产物,独立学院的出现不仅对高等教育的办学机制进行了大胆探索,扩大了高等教育的教育资源,而且还对高校办学规模方面起到了积极促进作用。独立学院经过十多年的发展,进入内涵发展期后,其办学质量越来越被社会各界所关注。独立学院应如何培养高素质的应用型人才?如何按照国家教育部提出的“厚基础、宽口径”人才培养目标的指导性意见?创新人才培养方式,是高等教育管理工作者的一项重要课题。本研究以江西A高校独立学院为例,介绍了江西A高校独立学院课程设置情况以及学生自主选课的现状。采用问卷调查、文献比较法、人物访谈等研究方法,对独立学院学生自主选课存在的问题及其成因进行分析和研究,发现江西A高校独立学院在选课过程中出现的问题有：开课存在随意性；课程宣导能力较弱；课程库管理手段和方法缺乏；缺乏稳定优质的教师队伍；学生选课方法不得当；选课管理及相关制度建设滞后等问题进行了深入探讨。并在此基础上,探讨了如何完善江西A高校独立学院学生自主选课的途径和方法。进而提出了优化学分制模式下独立学院学生自主选课必须加强教学管理组织建设：建立健全教学制度体系；建立具有独立学院特色的教育及教学资源体系：建立科学合理的选课宣导机制、监控反馈机制以及选课保障体系。本研究为独立学院不断完善和调整育人机制和人才培养目标作了一定的探索,同时为独立学院实施学分制提供了一些可供参考的意见及建议。