云南野生稻抗病基因克隆、结构功能分析及其分子进化研究

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云南野生稻是我省乃至全世界珍贵的野生植物资源,是改良栽培稻,可供人类长期持续发掘利用的重要基因宝库。本论文立足云南野生稻及其他野生稻资源,研究野生稻中功能已知或未知的植物抗病基因。从云南不同野生稻及其他来源的野生稻中分离克隆了一些抗病基因、抗病相关基因或抗病相关基因片段。对所获得的基因或基因片段的结构、功能及其在野生稻或抗病基因本身的分子进化等方面展开了一系列相对系统的研究。先后从云南元江普通野生稻中克隆了一个完整的抗稻瘟病Pi-ta 基因和一个Pi-b 基因,并从不同种或类型的云南野生稻以及其他野生稻中克隆了抗稻瘟病Pi-ta、Pi-b 以及抗白叶枯病Xa21、Xa1 基因的部分序列,从云南不同野生稻中获得了大量的R-片段,通过分析这些R-片段,克隆了一个新的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶类抗病侯选基因。应用相关软件,对所克隆的的抗病基因或抗病侯选基因推导产物的二级结构与功能间的关系进行了探讨。依据所克隆的基因序列间的同源性分析,初步建立了一个云南野生稻及其他野生稻与栽培稻间的分子进化模型。同时构建了三个云南野生稻叶片的cDNA文库,其中一个云南元江普通野生稻自然状态下营养生长期叶片的cDNA 文库及两个由稻瘟病和白叶枯病病菌诱导下的疣粒野生稻和药用野生稻的cDNA 文库。在cDNA 文库构建过程中,建立了一种高效且简便快速的检测cDNA 文库中插入片段大小范围的方法。为进一步从云南野生稻中发掘有用的抗病基因奠定了良好基础。 第一部分:云南野生稻中抗病基因同源片段的克隆及研究从野生稻中大规模的分离克隆抗病基因相关片段(R-片段)尚未见报道。利用简并引物我们从云南不同野生稻中获得了60 多个可以编码完整氨基酸序列的R-片段,其中30 多个为NBS-LRR 类片段,15 个丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶类(STK)片段。此外还从小粒野生稻(Oryza minuta)、江西东乡普通野生稻(Oryza rufipogon)及长雄蕊野生稻(Oryza longistaminata)中获得了20 多个NBS-LRR类R-片段。并有选择性的在基因库中登录了20 个R-片段序列。对这些片段的序列分析发现,大多数R 片段与基因库中水稻及其他植物中获得的R 片段或基因
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