高新区是实现科技创新和产业化结合的主要形式，促进了发明或发现通畅地转移到产业领域，实现经济和社会效益。高新区在我国经济社会发展中起着重要推动作用，考察国内外科技园区的发展历程可以发现，科学园区在完善国家、区域创新系统，提高创新能力等方面发挥着重要的极化作用。同时，园区也是企业创新的温床，培育了良好的创新环境和创新文化，为企业创新奠定了坚实的基础。这些都说明，高新区在促进企业创新、提高创新能力等领域具有重要的现实意义，也应该发挥对经济发展的促进作用！我国各国家级高新区在地区经济乃至国家经济和社会发展中占有越来越重要的地位。主要表现在：(1)高新区已经是我国政治和经济改革和创新的核心区域和示范基地，其中很多创新是自主的知识创新；(2)高新技术产业的重要性；(3)高新区已经形成产业或地区簇群，产业簇群的复杂度和深度对地区经济的竞争力有直接影响；(4)高新区的创新示范效应和扩散能力实现了对周边地区和传统产业的辐射作用，有可能带动我国企业的升级换代和变革。在新的历史时期，面临我国自主创新的国家战略，高新区担负着推动国家经济发展的重任。发展高新技术产业，提升国家综合竞争力是高新区的根本宗旨，加强科技创新是高新区建设发展的首要任务，提高自主创新能力是高新区履行职能的根本要求。高新区自主创新系统的构建对于我国高新区实现二次腾飞具有重要意义，对推进我国自主创新战略的实施具有显著的带动作用。立足于服务企业创新、提高企业创新能力、提高本区域企业、产业、区域竞争力的基本考虑，本文系统研究了国家高新自主创新系统的相关问题，构建了国家高新区自主创新系统模型，分析了其中的创新平台构成，并提出了高新区自主创新系统的运行模式与机理，提出了构建国家高新区自主创新系统的相关建议。具体而言，本文的主要内容为：第1章，介绍课题研究的背景与意义，对国内外相关理论研究进行了归纳总结和评述，在此基础上拟定全文分析框架、研究思路与方法。第2章，从创新理论、创新系统理论、高新区及其发展理论三个方面构建了本文研究的理论基础。第3章，本文的核心章节，提出了高新区自主创新系统的概念，并分析了其内涵、特征与功能；构建了高新区自主创新系统的机构模型；分析了各构成要素之间的互动关系。第4章，分析了高新区自主创新系统的重要部分——创新平台的内涵、结构与功能，并提出了其构建途径。第5章，高新区自主创新的运行分析，分析了高新区自主创新的动力机制、运行机制和激励机制，并提出了运行模式。第6章，构建了高新区自主创新系统培育的支撑体系，并从人才、财税、服务、市场、技术等方面进行深入论述。第7章，对东湖高新区自主创新系统进行案例研究。概括了东湖高新区自主创新的基础条件，并提出了其自主创新系统构建的途径。第8章，全文总结与展望。本文的创新主要有以下几点：(1)提出了高新区自主创新系统的概念，并构建了其结构模型，分析了高新区自主创新系统的构成要素的互动关系；(2)提出了高新区自主创新系统的动力机制模型，该模型以企业为主体，整合了内、外部驱动因素，综合分析高新区自主创新系统的动力机制；(3)提出了高新区自主创新系统运行的四种模式：“核心企业主导+配套企业参与”模式、产业内的自主合作创新模式、政府主导模式、政府扶持模式。