原发性开角型青光眼患者小梁网组织表达谱的RNA-seq研究

来源 :汕头大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:anysome_921
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目的:本实验目的是使用RNA测序技术探讨原发性开角型青光眼(primary open-angle glaucoma, POAG)患者与正常人小梁网组织的基因表达谱,探讨CAV相关基因表达情况。  方法: POAG组小梁网组织来自POAG患者的小梁切除术,对照组使用正常人捐献眼。分别提取两组RNA并进行RNA测序,获得小梁网组织的基因表达谱,并使用PANTHER与DAVID生物信息分析网站分析两组间基因表达的差异,进而分析其与POAG关系。  结果:RNA测序共得到28821条基因;达到统计学显著的基因有22条(FDR<0.05),其中转录表达上升的基因有1条,表达下降的基因有21条。表达有所差异的基因功能集中,多涉及structural molecule activity,binding,transporter activity,developmental process, localization,multicellular organismal process,cell part,organelle,membrane等。其中多个参与外胚层发育过程的基因表达量下降;Keratin6A,Matrix metallopeptidase3,Aquaporin3, Haptoglobin基因表达量下降最为显著。  结论:本研究为全球首例使用 RNA测序方法研究小梁网表达谱。本研究结果显示POAG患者小梁网组织基因转录的变化可能引起小梁网结构的改变。
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