目的：研究浙江省啮齿动物中汉坦病毒流行情况及病毒型别，为该地区肾综合征出血热的预防控制提供科学依据。分析两株汉城病毒的遗传特征，研究其与已知汉坦病毒及其疫苗株之间的关系。　　 方法：于2006～2007年在HFRS疫区：宁波慈溪和温州的瑞安、瓯海的疫点周围的野外及居民区用鼠笼捕鼠，采集鼠肺标本。用间接免疫荧光法（IFA）检测鼠肺中HV抗原，从抗原阳性鼠肺组织中提取RNA，用RT-PCR法扩增阳性样品中HV的S和M基因片段，纯化回收测序后，将扩增片段的核苷酸序列与已知病毒的核苷酸序列进行比较，使用DNAStar软件包进行序列排序及同源性分析，用PHYLIP软件包进行系统发生分析，以邻位相连法（Neighbor-joining method，NJ）构建系统发生树进行系统发生分析及分型。对扩增到的两株HV的全M与S基因片段测序后进行序列特征分析和系统发生分析。使用Protean、SignalP、TMHMM软件对基因片段核苷酸序列的疏水区、信号肽区和跨膜区进行分析。　　 结果：在慈溪和温州这两个地区共捕获461只啮齿动物、199只食虫目动物。其中在241只褐家鼠中检测到10份阳性样品，阳性检出率为4.15％，在122只黄胸鼠中检测到10份阳性标本，检出率为8.20％，在196只鼩鼱中检测到6份抗原阳性标本，检出率为3.06％。用汉城病毒（SEOV）特异引物从其中17份HV抗原阳性样品中扩增出17份部分S片段（620～999nt）、14份全S片段、2份全M片段及15份部分M片段（2001～2301nt）并测定序列。对扩增出的部分S、M及全S、M片段的核苷酸序列分析发现，17株病毒与现有的SEOV有高同源性，均为汉城型HV，所构建的系统进化树显示，17株病毒构成两个单元支，分别在第一和第三亚型，近年来的分子流行病学发现，已知的SEOV中以1和3基因亚型在我国分布最为广泛。汉坦病毒CixiRn21株和OuhaiRn251株的S基因片段核苷酸序列全长均为1771nt，都仅有1个开放读码框（ORF），编码429个氨基酸，M基因片段核苷酸序列全长均为3654nt，编码1133个氨基酸。这两株汉坦病毒与绝大部分已知的SEOV有最高的同源性；但与汉滩病毒等其它病毒同源性较低。这两株病毒的核蛋白与糖蛋白氨基酸序列与疫苗株Z37具有一致的结构。　　 结论：由于捕获的啮齿动物中以鼠属居多并且仅在啮齿动物中扩增到HV，因此推测浙江省现阶段的肾综合征出血热可能主要是由SEOV引起的，所以应加强对SEOV引起的出血热的监测和防治工作。所扩增到的17株汉坦病毒间有很高的同源性，没有明显的地理聚集现象，SEOV呈世界性分布，而且除Gou3外核苷酸和氨基酸的序列较为保守，变异较小，有高度的同源性，可能是因为存在共同的祖先以及SEOV的宿主动物（褐家鼠等鼠类）比其它宿主动物的流动性强，容易追随人类活动而迁徙，从而造成SEOV的播散。CixiRn21株和OuhaiRn251株与包括疫苗株Z37在内的已知SEOV具有高度的同源性和相似的二级结构，提示当前的疫苗能有效预防HFRS的流行。