HZ药业企业在发展过程中，生产过程、组织架构等不断调整使得当前的成本核算系统已无法满足企业的需求，且当前的成本核算方式只注重人工工时的核算，而忽视对产品成本的核算，造成成本信息不准确、成本浪费，无法为企业管理决策提供依据。此外，在成本控制基础上，如何对企业绩效进行评价达到企业决策管理的目的具有重要意义。当前，HZ药业企业的财务核算系统与作业成本系统数据源不同，造成异构性、自治性等问题，需要进行数据集成及清理，实现异构数据源间的共享。本文采用面向服务架构，Web Services等相关技术进行数据集成，并对同步到的数据采用不完整数据算法进行清理，最终得到集成数据。在成本控制基础上，以平衡计分卡为指导分级建立指标体系，并以层次分析法对指标进行权重配比，设计并开发绩效评价系统。本文的主要内容如下：（1）阐述了本论文的课题研究背景，介绍了数据集成、绩效评价的国内外研究现状，介绍了成本控制的过程、原则，数据集成的方法原理及数据清理原理，介绍了三种绩效管理的方式，并对我国实行绩效评价所面对的问题进行说明。（2）研究数据集成及清理模型，并以HZ药业企业ABC成本计算系统与NC财务核算系统间数据集成为背景，提出不完整数据清理算法，并实现数据清理，完成数据集成系统设计。（3）设计了绩效评价指标体系。根据HZ药业企业实际情况，采用平衡计分卡及层次分析法，确定指标选择与权重配比，分级设计公司及部门的指标体系。（4）在.Net平台下，采用B/S架构，根据HZ药业企业的实际，设计并实现绩效评价系统。并以企业108车间为例在企业运用绩效评价系统。通过对HZ药业企业的成本控制研究，针对其异构数据源的同步及同步后的数据清理问题设计并实现数据集成系统，实现了HZ药业企业对数据集成的需求，为绩效评价提供成本数据。采用平衡计分卡、分级构建方式构建绩效评价系统指标体系，并设计并实现绩效评价系统，帮助企业管理决策。