水稻是世界上最重要的粮食作物之一，世界上半数以上的人口以水稻为主食，大多数水稻重要农艺性状如产量、品质、抗逆性等多为数量性状，因此对数量性状基因位点（QTLs）准确定位分析在水稻遗传改良上具有重要意义。尤其是利用全基因组完成测序的材料进行数量性状研究，为进一步开展QIL功能解析打下基础，本研究选用两个测序水稻品种“培矮64S和日本晴”，配制杂交组合“培矮64S／日本晴”F₁构建重组自交系群体“F_2：8310个株系”，并对RIL群体进行评价，用该群体构建了一张SSR标记连锁图谱“简称F₈图谱”，将该图分别与相同组合F₂群体图谱和日本晴序列图比，分析分离标记的概况，其主要结果如下：1．利用组合杂种“培矮64S／日本晴”F₁建立重组自交系（RIL）群体，分别在四川和海南种植；F₂、F₄、F₆、F₈在四川温江种植，F₁、F₃、F₅、F₇在海南凌水种植，最后得到310个F_2：8株系。重组自交系RIL群体性状评检测评价结果为；分蘖数、穗数、株高3类性状纯合度分别为60.61％、90％、50.61％，分子标记评价结果为；RIL群体纯合度为96.03％，杂合度为3.97％。2．选用515对SSR引物对双亲培矮64S和日本晴间进行多态性检测，有157对引物在双亲间表现明显多态性，多态性频率为30.48％，以此构建了包含109个标记的连锁图（简称F₈图谱），该图谱包含18个连锁群，覆盖基因组2732.6cM，标记间平均距离25.07cM。3．本图谱分别与F₂图谱进行比较，两图在连锁群、标记定位数、标记顺序、总基因组长度、标记平均距离等方面都存在差异。进一步与日本晴序列图比较，109个标记有91个标记能确定在基因组序列图上，有18个标记未能在序列图找到相应的位置，91个标记覆盖的物理距离为159.8Mb，标记间平均物理距离为2159.46kb。4．在RIL群体中偏分离标记较多；定位在F₈图谱有63个分子标记表现偏分离（P＜0.05），占定位标记数的68.48％，这些偏分离标记中有60个偏向母本培矮64S，只有3个标记偏向父本日本晴；另外还有48个未定位标记，其中27个标记偏分离、21个正常分离，可能与偏分离有关。5．F₈图上12条染色体上共分布了60个偏分离标记，占偏分离标记的95.24％，这些标记以成簇的形式分布在染色体，形成偏分离的热点区，分别命名为：SDR1-1、SDR1-2、SDR2、SDR3-1、SDR3-2、SDR4、SDR5-1、SDR5-2、SDR6-1、SDR6-2、SDR8、SDR9-1、SDR9-2、SDR11和SDR12。几乎所有热点区域都偏向母本Pei’ai 64S，SDR1-1区域有2个标记偏向父本Nipponbare，不在热点区域内的偏分离标记在染色体上均为孤立分散分布。